Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TCIRG1Q13488 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TCIRG1Q13488 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TCIRG1Q13488 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TCIRG1Q13488 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
TCIRG1Q13488 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TCIRG1Q13488 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TCIRG1Q13488 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
TCIRG1Q13488 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TCIRG1Q13488 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TCIRG1Q13488 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TCIRG1Q13488 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TCIRG1Q13488 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TCIRG1Q13488 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TCIRG1Q13488 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
TCIRG1Q13488 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
TCIRG1Q13488 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TCIRG1Q13488 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
TCIRG1Q13488 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TCIRG1Q13488 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
TCIRG1Q13488 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
TCIRG1Q13488 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TCIRG1Q13488 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TCIRG1Q13488 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TCIRG1Q13488 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TCIRG1Q13488 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TCIRG1Q13488 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TCIRG1Q13488 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TCIRG1Q13488 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TCIRG1Q13488 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TCIRG1Q13488 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TCIRG1Q13488 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TCIRG1Q13488 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TCIRG1Q13488 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TCIRG1Q13488 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TCIRG1Q13488 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
TCIRG1Q13488 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
TCIRG1Q13488 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TCIRG1Q13488 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TCIRG1Q13488 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TCIRG1Q13488 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TCIRG1Q13488 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
TCIRG1Q13488 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TCIRG1Q13488 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TCIRG1Q13488 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TCIRG1Q13488 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TCIRG1Q13488 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TCIRG1Q13488 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TCIRG1Q13488 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TCIRG1Q13488 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TCIRG1Q13488 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TCIRG1Q13488 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
TCIRG1Q13488 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TCIRG1Q13488 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TCIRG1Q13488 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
TCIRG1Q13488 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TCIRG1Q13488 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TCIRG1Q13488 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TCIRG1Q13488 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TCIRG1Q13488 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TCIRG1Q13488 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TCIRG1Q13488 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TCIRG1Q13488 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
TCIRG1Q13488 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TCIRG1Q13488 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TCIRG1Q13488 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TCIRG1Q13488 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TCIRG1Q13488 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TCIRG1Q13488 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TCIRG1Q13488 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TCIRG1Q13488 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TCIRG1Q13488 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TCIRG1Q13488 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TCIRG1Q13488 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TCIRG1Q13488 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TCIRG1Q13488 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TCIRG1Q13488 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TCIRG1Q13488 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TCIRG1Q13488 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TCIRG1Q13488 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TCIRG1Q13488 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TCIRG1Q13488 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TCIRG1Q13488 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TCIRG1Q13488 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TCIRG1Q13488 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TCIRG1Q13488 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TCIRG1Q13488 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TCIRG1Q13488 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TCIRG1Q13488 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TCIRG1Q13488 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TCIRG1Q13488 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TCIRG1Q13488 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TCIRG1Q13488 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TCIRG1Q13488 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TCIRG1Q13488 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TCIRG1Q13488 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TCIRG1Q13488 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TCIRG1Q13488 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
TCIRG1Q13488 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
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