Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.98
SF3B2Q13435 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
SF3B2Q13435 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.36■■■■■ 4.85
SF3B2Q13435 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SF3B2Q13435 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SF3B2Q13435 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SF3B2Q13435 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
SF3B2Q13435 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SF3B2Q13435 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SF3B2Q13435 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SF3B2Q13435 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SF3B2Q13435 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SF3B2Q13435 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
SF3B2Q13435 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SF3B2Q13435 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
SF3B2Q13435 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SF3B2Q13435 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SF3B2Q13435 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SF3B2Q13435 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
SF3B2Q13435 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SF3B2Q13435 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
SF3B2Q13435 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
SF3B2Q13435 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
SF3B2Q13435 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
SF3B2Q13435 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SF3B2Q13435 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SF3B2Q13435 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SF3B2Q13435 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SF3B2Q13435 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SF3B2Q13435 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SF3B2Q13435 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SF3B2Q13435 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SF3B2Q13435 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SF3B2Q13435 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SF3B2Q13435 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
SF3B2Q13435 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SF3B2Q13435 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
SF3B2Q13435 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SF3B2Q13435 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SF3B2Q13435 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SF3B2Q13435 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SF3B2Q13435 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SF3B2Q13435 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SF3B2Q13435 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SF3B2Q13435 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SF3B2Q13435 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SF3B2Q13435 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SF3B2Q13435 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SF3B2Q13435 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SF3B2Q13435 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
SF3B2Q13435 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SF3B2Q13435 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SF3B2Q13435 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SF3B2Q13435 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SF3B2Q13435 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SF3B2Q13435 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SF3B2Q13435 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SF3B2Q13435 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SF3B2Q13435 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SF3B2Q13435 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SF3B2Q13435 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SF3B2Q13435 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SF3B2Q13435 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SF3B2Q13435 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SF3B2Q13435 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SF3B2Q13435 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SF3B2Q13435 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SF3B2Q13435 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SF3B2Q13435 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SF3B2Q13435 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
SF3B2Q13435 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SF3B2Q13435 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SF3B2Q13435 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SF3B2Q13435 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SF3B2Q13435 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SF3B2Q13435 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SF3B2Q13435 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SF3B2Q13435 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SF3B2Q13435 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SF3B2Q13435 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SF3B2Q13435 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
SF3B2Q13435 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SF3B2Q13435 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SF3B2Q13435 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SF3B2Q13435 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SF3B2Q13435 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SF3B2Q13435 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
SF3B2Q13435 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
SF3B2Q13435 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SF3B2Q13435 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SF3B2Q13435 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SF3B2Q13435 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SF3B2Q13435 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SF3B2Q13435 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
SF3B2Q13435 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SF3B2Q13435 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
SF3B2Q13435 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
SF3B2Q13435 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
SF3B2Q13435 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
SF3B2Q13435 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
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