Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PSMD2-212ENST00000473991 590 ntTSL 315.54■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 29.6
G3BP1Q13283 ADH5-206ENST00000507102 570 ntTSL 28.07□□□□□ -1.127e-13■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 ADH5-202ENST00000502386 545 ntTSL 57.34□□□□□ -1.237e-13■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-208ENST00000478116 641 ntTSL 221.39■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.914e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-211ENST00000482482 486 ntTSL 520.61■□□□□ 0.894e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.854e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.494e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-212ENST00000483615 822 ntTSL 317.48■□□□□ 0.394e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 SEC23A-214ENST00000557437 575 ntTSL 418.53■□□□□ 0.566e-10■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 LTB4R2-201ENST00000527924 710 ntTSL 329.99■■■□□ 2.392e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 UNG-203ENST00000446767 2016 ntTSL 1 (best)23.8■■□□□ 1.42e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 SUPT5H-210ENST00000598117 859 ntTSL 223.27■■□□□ 1.322e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 UNG-204ENST00000539287 2234 ntTSL 520.87■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 UNG-205ENST00000540158 498 ntTSL 220.73■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-211ENST00000509087 619 ntTSL 211.86□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 ADHFE1-218ENST00000523113 557 ntTSL 25.2□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HECTD1-205ENST00000554027 556 ntTSL 24.22□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 29.3
G3BP1Q13283 SEC16A-209ENST00000472305 537 ntTSL 315.96■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 29.3
G3BP1Q13283 ALDH1A1-203ENST00000419959 806 ntTSL 58.98□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 RXRB-204ENST00000483281 1977 ntTSL 525.68■■□□□ 1.78e-8■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.158e-8■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 RXRB-203ENST00000481441 1330 ntTSL 221.28■■□□□ 18e-8■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.898e-8■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 PSME1-207ENST00000560420 922 ntTSL 218.15■□□□□ 0.54e-12■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 PSME1-204ENST00000558112 651 ntTSL 511.41□□□□□ -0.584e-12■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 SF3B2-216ENST00000534765 3932 ntTSL 210.66□□□□□ -0.79e-14■■■■■ 29.1
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.025e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.795e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 TRIM47-204ENST00000587339 1907 ntTSL 1 (best)24.43■■□□□ 1.52e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 TRIM47-206ENST00000592942 793 ntTSL 218.99■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 28.9
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G3BP1Q13283 IQGAP2-206ENST00000504477 2039 ntTSL 57.79□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.46e-7■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 411.05□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 PSMB3-210ENST00000618159 562 ntTSL 211.09□□□□□ -0.638e-10■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 NME1-210ENST00000512768 1056 ntTSL 1 (best)22.24■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 NME1-208ENST00000487481 987 ntTSL 218.6■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 NME1-205ENST00000465188 521 ntTSL 211.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 NME1-204ENST00000456492 510 ntTSL 25.96□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 PSMD2-220ENST00000496925 723 ntTSL 212.63□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 LDHAP7-201ENST00000398295 965 ntBASIC11.22□□□□□ -0.616e-12■■■■■ 28.7
G3BP1Q13283 PRDX1-206ENST00000483583 530 ntTSL 227.8■■■□□ 2.042e-13■■■■■ 28.7
G3BP1Q13283 APEH-213ENST00000480772 703 ntTSL 216.12■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 28.7
G3BP1Q13283 ERBB3-216ENST00000550869 572 ntTSL 414.93□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 CTNNB1-213ENST00000482042 1366 ntTSL 28.25□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 28.6
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G3BP1Q13283 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.922e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.792e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.782e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.772e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.142e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.042e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 PSME1-209ENST00000561142 865 ntTSL 516.54■□□□□ 0.241e-12■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 DCTN1-217ENST00000463583 569 ntTSL 422.14■■□□□ 1.131e-13■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 DCTN1-219ENST00000470351 557 ntTSL 218.88■□□□□ 0.611e-13■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 319.83■□□□□ 0.775e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.153e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 MACF1-223ENST00000496360 2080 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 ABCF1-204ENST00000468958 606 ntTSL 315.49■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 MACF1-225ENST00000497807 2689 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 PTPA-211ENST00000417504 567 ntTSL 410.01□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 MACF1-206ENST00000422234 477 ntTSL 59.47□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 MACF1-210ENST00000462496 526 ntTSL 36.13□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 PRPF8-212ENST00000575116 460 ntTSL 314.75□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 28.4
G3BP1Q13283 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 212.49□□□□□ -0.413e-16■■■■■ 28.3
G3BP1Q13283 PSMB6-204ENST00000575643 666 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 222.6■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 PEPD-209ENST00000590755 547 ntTSL 321.16■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 PEPD-207ENST00000590408 433 ntTSL 312.1□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 GCN1-206ENST00000549815 543 ntTSL 316.6■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 AARS-204ENST00000566969 610 ntTSL 212.14□□□□□ -0.472e-14■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PDCD4-211ENST00000498367 975 ntTSL 38.3□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PLIN3-205ENST00000589163 1699 ntTSL 318.27■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PRKDC-210ENST00000541488 719 ntTSL 33.51□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 28
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