RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592528.5

PLIN3-207, Transcript of perilipin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PLIN3, Length 2,154 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3-207ENST00000592528 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.86■■■□□ 2.53
PLIN3-207ENST00000592528 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.49■■□□□ 1.83
PLIN3-207ENST00000592528 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PLIN3-207ENST00000592528 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.93■■□□□ 1.74
PLIN3-207ENST00000592528 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.81■■□□□ 1.72
PLIN3-207ENST00000592528 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.3■■□□□ 1.64
PLIN3-207ENST00000592528 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PLIN3-207ENST00000592528 ABCC9O60706 1549 aa25.11■■□□□ 1.61
PLIN3-207ENST00000592528 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.78■■□□□ 1.56
PLIN3-207ENST00000592528 SCRIBQ14160 1630 aa24.78■■□□□ 1.56
PLIN3-207ENST00000592528 NACADO15069 1562 aa24.64■■□□□ 1.53
PLIN3-207ENST00000592528 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.38■■□□□ 1.49
PLIN3-207ENST00000592528 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PLIN3-207ENST00000592528 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.14■■□□□ 1.45
PLIN3-207ENST00000592528 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.13■■□□□ 1.45
PLIN3-207ENST00000592528 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.98■■□□□ 1.43
PLIN3-207ENST00000592528 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.98■■□□□ 1.43
PLIN3-207ENST00000592528 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
PLIN3-207ENST00000592528 WIZO95785 1651 aa23.81■■□□□ 1.4
PLIN3-207ENST00000592528 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PLIN3-207ENST00000592528 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.74■■□□□ 1.39
PLIN3-207ENST00000592528 SMARCA4P51532 1647 aa23.62■■□□□ 1.37
PLIN3-207ENST00000592528 TRIM41Q8WV44 630 aa23.45■■□□□ 1.34
PLIN3-207ENST00000592528 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PLIN3-207ENST00000592528 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.42■■□□□ 1.34
PLIN3-207ENST00000592528 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.33■■□□□ 1.33
PLIN3-207ENST00000592528 SMARCA2P51531 1590 aa23.28■■□□□ 1.32
PLIN3-207ENST00000592528 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PLIN3-207ENST00000592528 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PLIN3-207ENST00000592528 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.19■■□□□ 1.3
PLIN3-207ENST00000592528 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.18■■□□□ 1.3
PLIN3-207ENST00000592528 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.11■■□□□ 1.29
PLIN3-207ENST00000592528 ABCC8Q09428 1581 aa23.09■■□□□ 1.29
PLIN3-207ENST00000592528 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PLIN3-207ENST00000592528 NCAPD3P42695 1498 aa22.82■■□□□ 1.24
PLIN3-207ENST00000592528 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.78■■□□□ 1.24
PLIN3-207ENST00000592528 HMGXB3Q12766 1538 aa22.76■■□□□ 1.23
PLIN3-207ENST00000592528 SOGA1O94964 1423 aa22.75■■□□□ 1.23
PLIN3-207ENST00000592528 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
PLIN3-207ENST00000592528 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.68■■□□□ 1.22
PLIN3-207ENST00000592528 SYNJ1O43426 1573 aa22.67■■□□□ 1.22
PLIN3-207ENST00000592528 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.58■■□□□ 1.21
PLIN3-207ENST00000592528 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.55■■□□□ 1.2
PLIN3-207ENST00000592528 HRCP23327 699 aa22.53■■□□□ 1.2
PLIN3-207ENST00000592528 CFTRP13569 1480 aa22.47■■□□□ 1.19
PLIN3-207ENST00000592528 EEA1Q15075 1411 aa22.47■■□□□ 1.19
PLIN3-207ENST00000592528 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PLIN3-207ENST00000592528 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PLIN3-207ENST00000592528 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PLIN3-207ENST00000592528 TOP2BQ02880 1626 aa22.42■■□□□ 1.18
PLIN3-207ENST00000592528 CUX1P39880 1505 aa22.36■■□□□ 1.17
PLIN3-207ENST00000592528 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.35■■□□□ 1.17
PLIN3-207ENST00000592528 CEP162Q5TB80 1403 aa22.34■■□□□ 1.17
PLIN3-207ENST00000592528 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.34■■□□□ 1.17
PLIN3-207ENST00000592528 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.34■■□□□ 1.17
PLIN3-207ENST00000592528 GOLGA3Q08378 1498 aa22.32■■□□□ 1.16
PLIN3-207ENST00000592528 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.25■■□□□ 1.15
PLIN3-207ENST00000592528 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.25■■□□□ 1.15
PLIN3-207ENST00000592528 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.22■■□□□ 1.15
PLIN3-207ENST00000592528 KIF21BO75037 1637 aa22.21■■□□□ 1.15
PLIN3-207ENST00000592528 PRDM2Q13029 1718 aa22.21■■□□□ 1.15
PLIN3-207ENST00000592528 NESP48681 1621 aa22.19■■□□□ 1.14
PLIN3-207ENST00000592528 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PLIN3-207ENST00000592528 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PLIN3-207ENST00000592528 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.13■■□□□ 1.13
PLIN3-207ENST00000592528 KIF27Q86VH2 1401 aa22.09■■□□□ 1.13
PLIN3-207ENST00000592528 CLIP1P30622 1438 aa22.06■■□□□ 1.12
PLIN3-207ENST00000592528 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.06■■□□□ 1.12
PLIN3-207ENST00000592528 PRXQ9BXM0 1461 aa22.05■■□□□ 1.12
PLIN3-207ENST00000592528 CUX2O14529 1486 aa22.03■■□□□ 1.12
PLIN3-207ENST00000592528 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.95■■□□□ 1.1
PLIN3-207ENST00000592528 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.93■■□□□ 1.1
PLIN3-207ENST00000592528 IGF1RP08069 1367 aa21.93■■□□□ 1.1
PLIN3-207ENST00000592528 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.92■■□□□ 1.1
PLIN3-207ENST00000592528 TOPBP1Q92547 1522 aa21.92■■□□□ 1.1
PLIN3-207ENST00000592528 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.91■■□□□ 1.1
PLIN3-207ENST00000592528 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PLIN3-207ENST00000592528 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.87■■□□□ 1.09
PLIN3-207ENST00000592528 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PLIN3-207ENST00000592528 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.82■■□□□ 1.08
PLIN3-207ENST00000592528 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.82■■□□□ 1.08
PLIN3-207ENST00000592528 ARAP1Q96P48 1450 aa21.78■■□□□ 1.08
PLIN3-207ENST00000592528 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.77■■□□□ 1.08
PLIN3-207ENST00000592528 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.77■■□□□ 1.07
PLIN3-207ENST00000592528 APLP2Q06481 763 aa21.75■■□□□ 1.07
PLIN3-207ENST00000592528 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PLIN3-207ENST00000592528 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PLIN3-207ENST00000592528 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.7■■□□□ 1.06
PLIN3-207ENST00000592528 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PLIN3-207ENST00000592528 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PLIN3-207ENST00000592528 P3H3Q8IVL6 736 aa21.61■■□□□ 1.05
PLIN3-207ENST00000592528 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PLIN3-207ENST00000592528 WDR97A6NE52 1622 aa21.6■■□□□ 1.05
PLIN3-207ENST00000592528 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PLIN3-207ENST00000592528 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.56■■□□□ 1.04
PLIN3-207ENST00000592528 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.54■■□□□ 1.04
PLIN3-207ENST00000592528 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.53■■□□□ 1.04
PLIN3-207ENST00000592528 CUL7Q14999 1698 aa21.52■■□□□ 1.04
PLIN3-207ENST00000592528 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PLIN3-207ENST00000592528 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.039e-8■■■■■ 33.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms