RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483281.5

RXRB-204, Transcript of retinoid X receptor beta, humanhuman

TSL 5

Gene RXRB, Length 1,977 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRB-204ENST00000483281 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.82■■■■■ 5.41
RXRB-204ENST00000483281 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.05■■■■■ 4.48
RXRB-204ENST00000483281 ABCC9O60706 1549 aa41.25■■■■■ 4.19
RXRB-204ENST00000483281 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
RXRB-204ENST00000483281 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.49■■■■■ 4.07
RXRB-204ENST00000483281 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.39■■■■■ 4.06
RXRB-204ENST00000483281 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.38■■■■■ 4.05
RXRB-204ENST00000483281 NACADO15069 1562 aa40.3■■■■■ 4.04
RXRB-204ENST00000483281 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.12■■■■■ 4.01
RXRB-204ENST00000483281 SCRIBQ14160 1630 aa39.25■■■■□ 3.87
RXRB-204ENST00000483281 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.22■■■■□ 3.87
RXRB-204ENST00000483281 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.93■■■■□ 3.82
RXRB-204ENST00000483281 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.87■■■■□ 3.81
RXRB-204ENST00000483281 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.7■■■■□ 3.79
RXRB-204ENST00000483281 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.9■■■■□ 3.66
RXRB-204ENST00000483281 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
RXRB-204ENST00000483281 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.63
RXRB-204ENST00000483281 SMARCA4P51532 1647 aa37.69■■■■□ 3.62
RXRB-204ENST00000483281 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.61■■■■□ 3.61
RXRB-204ENST00000483281 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
RXRB-204ENST00000483281 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.4■■■■□ 3.58
RXRB-204ENST00000483281 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.37■■■■□ 3.57
RXRB-204ENST00000483281 SMARCA2P51531 1590 aa37.29■■■■□ 3.56
RXRB-204ENST00000483281 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.29■■■■□ 3.56
RXRB-204ENST00000483281 WIZO95785 1651 aa37.24■■■■□ 3.55
RXRB-204ENST00000483281 NCAPD3P42695 1498 aa37.19■■■■□ 3.54
RXRB-204ENST00000483281 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.18■■■■□ 3.54
RXRB-204ENST00000483281 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
RXRB-204ENST00000483281 HMGXB3Q12766 1538 aa37.05■■■■□ 3.52
RXRB-204ENST00000483281 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
RXRB-204ENST00000483281 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
RXRB-204ENST00000483281 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.48■■■■□ 3.43
RXRB-204ENST00000483281 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.13■■■■□ 3.37
RXRB-204ENST00000483281 CFTRP13569 1480 aa36.09■■■■□ 3.37
RXRB-204ENST00000483281 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.05■■■■□ 3.36
RXRB-204ENST00000483281 NESP48681 1621 aa35.95■■■■□ 3.35
RXRB-204ENST00000483281 PRDM2Q13029 1718 aa35.89■■■■□ 3.34
RXRB-204ENST00000483281 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.78■■■■□ 3.32
RXRB-204ENST00000483281 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.67■■■■□ 3.3
RXRB-204ENST00000483281 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.57■■■■□ 3.29
RXRB-204ENST00000483281 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.54■■■■□ 3.28
RXRB-204ENST00000483281 ERCC6Q03468 1493 aa35.49■■■■□ 3.27
RXRB-204ENST00000483281 ABCC8Q09428 1581 aa35.33■■■■□ 3.25
RXRB-204ENST00000483281 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.32■■■■□ 3.25
RXRB-204ENST00000483281 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.32■■■■□ 3.245e-6■■■■■ 29.2
RXRB-204ENST00000483281 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
RXRB-204ENST00000483281 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
RXRB-204ENST00000483281 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.23■■■■□ 3.23
RXRB-204ENST00000483281 CUX1P39880 1505 aa35.22■■■■□ 3.23
RXRB-204ENST00000483281 TOPBP1Q92547 1522 aa35.2■■■■□ 3.23
RXRB-204ENST00000483281 WDR62O43379 1518 aa35.2■■■■□ 3.22
RXRB-204ENST00000483281 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.18■■■■□ 3.22
RXRB-204ENST00000483281 TOP2BQ02880 1626 aa35.17■■■■□ 3.22
RXRB-204ENST00000483281 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.17■■■■□ 3.22
RXRB-204ENST00000483281 SYNJ1O43426 1573 aa35.16■■■■□ 3.22
RXRB-204ENST00000483281 TRIM41Q8WV44 630 aa35.06■■■■□ 3.2
RXRB-204ENST00000483281 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.97■■■■□ 3.19
RXRB-204ENST00000483281 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
RXRB-204ENST00000483281 CUX2O14529 1486 aa34.89■■■■□ 3.18
RXRB-204ENST00000483281 SOGA1O94964 1423 aa34.85■■■■□ 3.17
RXRB-204ENST00000483281 IFT140Q96RY7 1462 aa34.79■■■■□ 3.16
RXRB-204ENST00000483281 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
RXRB-204ENST00000483281 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.77■■■■□ 3.16
RXRB-204ENST00000483281 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.72■■■■□ 3.15
RXRB-204ENST00000483281 WDR97A6NE52 1622 aa34.67■■■■□ 3.14
RXRB-204ENST00000483281 KIF27Q86VH2 1401 aa34.53■■■■□ 3.12
RXRB-204ENST00000483281 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
RXRB-204ENST00000483281 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
RXRB-204ENST00000483281 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.48■■■■□ 3.11
RXRB-204ENST00000483281 EEA1Q15075 1411 aa34.45■■■■□ 3.11
RXRB-204ENST00000483281 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.45■■■■□ 3.114e-8■■■□□ 14.7
RXRB-204ENST00000483281 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.45■■■■□ 3.11
RXRB-204ENST00000483281 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.44■■■■□ 3.1
RXRB-204ENST00000483281 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
RXRB-204ENST00000483281 GRIN2BQ13224 1484 aa34.34■■■■□ 3.09
RXRB-204ENST00000483281 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.33■■■■□ 3.09
RXRB-204ENST00000483281 IGF1RP08069 1367 aa34.32■■■■□ 3.08
RXRB-204ENST00000483281 PBRM1Q86U86 1689 aa34.3■■■■□ 3.08
RXRB-204ENST00000483281 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.29■■■■□ 3.08
RXRB-204ENST00000483281 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
RXRB-204ENST00000483281 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
RXRB-204ENST00000483281 CUL7Q14999 1698 aa34.16■■■■□ 3.06
RXRB-204ENST00000483281 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.12■■■■□ 3.05
RXRB-204ENST00000483281 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.12■■■■□ 3.05
RXRB-204ENST00000483281 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.09■■■■□ 3.05
RXRB-204ENST00000483281 PRXQ9BXM0 1461 aa34.09■■■■□ 3.05
RXRB-204ENST00000483281 ADAMTS12P58397 1594 aa34.06■■■■□ 3.04
RXRB-204ENST00000483281 SYNJ2O15056 1496 aa34.01■■■■□ 3.04
RXRB-204ENST00000483281 KIF21BO75037 1637 aa34■■■■□ 3.03
RXRB-204ENST00000483281 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34■■■■□ 3.03
RXRB-204ENST00000483281 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
RXRB-204ENST00000483281 GRIN2AQ12879 1464 aa33.88■■■■□ 3.01
RXRB-204ENST00000483281 FBLN2P98095 1184 aa33.85■■■■□ 3.01
RXRB-204ENST00000483281 CHD1O14646 1710 aa33.85■■■■□ 3.01
RXRB-204ENST00000483281 GOLGA3Q08378 1498 aa33.84■■■■□ 3.01
RXRB-204ENST00000483281 NUP160Q12769 1436 aa33.72■■■□□ 2.99
RXRB-204ENST00000483281 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.71■■■□□ 2.99
RXRB-204ENST00000483281 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
RXRB-204ENST00000483281 CEP170Q5SW79 1584 aa33.66■■■□□ 2.98
RXRB-204ENST00000483281 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.65■■■□□ 2.98
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