Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)26.75■■□□□ 1.871e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 223.4■■□□□ 1.341e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 222.33■■□□□ 1.171e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.051e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.611e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 511.25□□□□□ -0.611e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 311.25□□□□□ -0.611e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 39.65□□□□□ -0.861e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 44.79□□□□□ -1.641e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 53.39□□□□□ -1.871e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 53.29□□□□□ -1.881e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.191e-39■■■■■ 140
G3BP1Q13283 PHGDH-217ENST00000641455 312 nt9.56□□□□□ -0.881e-17■■■■■ 78.8
G3BP1Q13283 ANXA4-206ENST00000468815 521 ntTSL 316.86■□□□□ 0.293e-10■■■■■ 51
G3BP1Q13283 ANXA4-208ENST00000472124 376 ntTSL 39.36□□□□□ -0.913e-10■■■■■ 51
G3BP1Q13283 RPS6KA3-204ENST00000474266 930 ntTSL 314.44□□□□□ -0.19e-13■■■■■ 46
G3BP1Q13283 RPS6KA3-203ENST00000457145 804 ntTSL 22.78□□□□□ -1.969e-13■■■■■ 46
G3BP1Q13283 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.144e-11■■■■■ 45.4
G3BP1Q13283 VPS35-206ENST00000565228 487 ntTSL 311.43□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 44.1
G3BP1Q13283 HECTD1-211ENST00000555915 775 ntTSL 511.01□□□□□ -0.652e-12■■■■■ 41.6
G3BP1Q13283 CAPNS1-213ENST00000592354 690 ntTSL 216.65■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 40.6
G3BP1Q13283 CAPNS1-203ENST00000586963 570 ntTSL 29.9□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 40.6
G3BP1Q13283 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.213e-10■■■■■ 40.4
G3BP1Q13283 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 220.93■□□□□ 0.943e-10■■■■■ 40.4
G3BP1Q13283 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.443e-10■■■■■ 40.4
G3BP1Q13283 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.413e-10■■■■■ 40.4
G3BP1Q13283 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-10■■■■■ 40.4
G3BP1Q13283 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.043e-10■■■■■ 40.4
G3BP1Q13283 HYOU1-208ENST00000531682 319 ntTSL 214.89□□□□□ -0.033e-10■■■■■ 40.4
G3BP1Q13283 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.173e-10■■■■■ 40.4
G3BP1Q13283 COPB1-204ENST00000526191 697 ntTSL 25.24□□□□□ -1.572e-12■■■■■ 39.6
G3BP1Q13283 MCM7-208ENST00000467516 776 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 39.5
G3BP1Q13283 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 39.5
G3BP1Q13283 PGM3-210ENST00000510258 750 ntTSL 313.88□□□□□ -0.192e-11■■■■■ 39.5
G3BP1Q13283 PGM3-205ENST00000506587 1971 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.412e-11■■■■■ 39.5
G3BP1Q13283 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 39.5
G3BP1Q13283 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.192e-11■■■■■ 39.5
G3BP1Q13283 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.262e-11■■■■■ 39.5
G3BP1Q13283 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 220.71■□□□□ 0.917e-11■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 PDXK-208ENST00000461123 637 ntTSL 319.93■□□□□ 0.787e-11■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 218.88■□□□□ 0.617e-11■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.397e-11■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.247e-11■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-11■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.277e-11■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.314e-9■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 519.72■□□□□ 0.754e-14■■■■■ 39.3
G3BP1Q13283 DHX8-205ENST00000589898 739 ntTSL 27.37□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 39.1
G3BP1Q13283 SPTAN1-215ENST00000628867 579 ntTSL 29.35□□□□□ -0.911e-11■■■■■ 39
G3BP1Q13283 PSMD1-207ENST00000447633 696 ntTSL 28.39□□□□□ -1.074e-9■■■■■ 38.7
G3BP1Q13283 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.471e-9■■■■■ 38.2
G3BP1Q13283 FH-203ENST00000497042 351 ntTSL 23.62□□□□□ -1.831e-9■■■■■ 38.2
G3BP1Q13283 PSMA6-212ENST00000556167 601 ntTSL 220.21■□□□□ 0.833e-24■■■■■ 37.9
G3BP1Q13283 MARS-220ENST00000549827 465 ntTSL 215.02■□□□□ -02e-7■■■■■ 37.7
G3BP1Q13283 C16orf58-205ENST00000565128 584 ntTSL 429.07■■■□□ 2.249e-11■■■■■ 37.7
G3BP1Q13283 C16orf58-203ENST00000541442 1056 ntTSL 227.08■■□□□ 1.939e-11■■■■■ 37.7
G3BP1Q13283 C16orf58-207ENST00000567578 636 ntTSL 427.08■■□□□ 1.939e-11■■■■■ 37.7
G3BP1Q13283 IL32-208ENST00000525003 544 ntTSL 219.4■□□□□ 0.79e-11■■■■■ 37.7
G3BP1Q13283 C16orf58-206ENST00000566148 441 ntTSL 216.72■□□□□ 0.279e-11■■■■■ 37.7
G3BP1Q13283 C16orf58-204ENST00000564807 555 ntTSL 415.99■□□□□ 0.159e-11■■■■■ 37.7
G3BP1Q13283 PHGDH-228ENST00000641847 692 nt11.57□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 37.6
G3BP1Q13283 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.123e-10■■■■■ 37.1
G3BP1Q13283 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 37.1
G3BP1Q13283 ENO1P1-201ENST00000366587 1304 ntBASIC12.45□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 37.1
G3BP1Q13283 CKAP5-204ENST00000525896 832 ntTSL 29.87□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 37.1
G3BP1Q13283 LETM1-204ENST00000510940 563 ntTSL 216.69■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 36.7
G3BP1Q13283 CAP1-219ENST00000494114 744 ntTSL 1 (best)5.83□□□□□ -1.487e-10■■■■■ 36.7
G3BP1Q13283 RPN1-208ENST00000497415 547 ntTSL 423.15■■□□□ 1.31e-11■■■■■ 36.6
G3BP1Q13283 RPN1-202ENST00000476931 526 ntTSL 421■□□□□ 0.951e-11■■■■■ 36.6
G3BP1Q13283 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-11■■■■■ 36.6
G3BP1Q13283 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.71e-11■■■■■ 36.6
G3BP1Q13283 RPN1-204ENST00000481168 751 ntTSL 215.38■□□□□ 0.051e-11■■■■■ 36.6
G3BP1Q13283 RPN1-206ENST00000495462 566 ntTSL 37.95□□□□□ -1.141e-11■■■■■ 36.6
G3BP1Q13283 SPTAN1-206ENST00000475367 2237 ntTSL 212.07□□□□□ -0.485e-10■■■■■ 36.6
G3BP1Q13283 VARS-220ENST00000461874 845 ntTSL 523.44■■□□□ 1.345e-7■■■■■ 36.4
G3BP1Q13283 VARS-226ENST00000483275 450 ntTSL 317.13■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 36.4
G3BP1Q13283 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 524.88■■□□□ 1.576e-10■■■■■ 35.9
G3BP1Q13283 YARS-205ENST00000472692 773 ntTSL 58.76□□□□□ -1.016e-10■■■■■ 35.9
G3BP1Q13283 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.992e-7■■■■■ 35.7
G3BP1Q13283 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 35.7
G3BP1Q13283 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 35.7
G3BP1Q13283 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.226e-10■■■■■ 34.9
G3BP1Q13283 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.036e-10■■■■■ 34.9
G3BP1Q13283 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.476e-10■■■■■ 34.9
G3BP1Q13283 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.956e-10■■■■■ 34.9
G3BP1Q13283 SPTAN1-227ENST00000635806 193 ntTSL 55.12□□□□□ -1.592e-9■■■■■ 34.2
G3BP1Q13283 NAP1L4-207ENST00000469805 2294 ntTSL 320.04■□□□□ 0.81e-9■■■■■ 34
G3BP1Q13283 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-9■■■■■ 34
G3BP1Q13283 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.731e-9■■■■■ 34
G3BP1Q13283 APOLD1-203ENST00000534843 2375 ntTSL 218.27■□□□□ 0.523e-9■■■■■ 33.7
G3BP1Q13283 DDX47-202ENST00000358007 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 33.7
G3BP1Q13283 DDX47-212ENST00000545038 2357 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 33.7
G3BP1Q13283 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.093e-9■■■■■ 33.7
G3BP1Q13283 DDX47-207ENST00000542123 2689 ntTSL 1 (best)4.18□□□□□ -1.743e-9■■■■■ 33.7
G3BP1Q13283 GTF2F1-204ENST00000594965 762 ntTSL 327.64■■■□□ 2.021e-8■■■■■ 33.6
G3BP1Q13283 GTF2F1-205ENST00000595047 1382 ntTSL 522.64■■□□□ 1.221e-8■■■■■ 33.6
G3BP1Q13283 GTF2F1-203ENST00000594213 1002 ntTSL 319.62■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 33.6
G3BP1Q13283 GTF2F1-202ENST00000593678 1705 ntTSL 218.4■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 33.6
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