RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320270.3

RRS1-201, Transcript of ribosome biogenesis regulator homolog, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene RRS1, Length 1,706 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1-201ENST00000320270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.05■■■■■ 4.64
RRS1-201ENST00000320270 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.59■■■■□ 3.77
RRS1-201ENST00000320270 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
RRS1-201ENST00000320270 ABCC9O60706 1549 aa36.67■■■■□ 3.46
RRS1-201ENST00000320270 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.48■■■■□ 3.43
RRS1-201ENST00000320270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.38■■■■□ 3.41
RRS1-201ENST00000320270 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.18■■■■□ 3.38
RRS1-201ENST00000320270 NACADO15069 1562 aa36.01■■■■□ 3.36
RRS1-201ENST00000320270 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.76■■■■□ 3.32
RRS1-201ENST00000320270 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.59■■■■□ 3.29
RRS1-201ENST00000320270 SCRIBQ14160 1630 aa35.35■■■■□ 3.25
RRS1-201ENST00000320270 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.98■■■■□ 3.19
RRS1-201ENST00000320270 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.66■■■■□ 3.14
RRS1-201ENST00000320270 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.11
RRS1-201ENST00000320270 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.2■■■■□ 3.07
RRS1-201ENST00000320270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
RRS1-201ENST00000320270 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
RRS1-201ENST00000320270 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
RRS1-201ENST00000320270 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.98■■■■□ 3.03
RRS1-201ENST00000320270 SMARCA4P51532 1647 aa33.91■■■■□ 3.02
RRS1-201ENST00000320270 WIZO95785 1651 aa33.67■■■□□ 2.98
RRS1-201ENST00000320270 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
RRS1-201ENST00000320270 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.56■■■□□ 2.96
RRS1-201ENST00000320270 SMARCA2P51531 1590 aa33.44■■■□□ 2.94
RRS1-201ENST00000320270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.44■■■□□ 2.94
RRS1-201ENST00000320270 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
RRS1-201ENST00000320270 NCAPD3P42695 1498 aa33.24■■■□□ 2.91
RRS1-201ENST00000320270 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
RRS1-201ENST00000320270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.21■■■□□ 2.91
RRS1-201ENST00000320270 HMGXB3Q12766 1538 aa33.17■■■□□ 2.9
RRS1-201ENST00000320270 CCDC88BA6NC98 1476 aa33■■■□□ 2.87
RRS1-201ENST00000320270 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.6■■■□□ 2.81
RRS1-201ENST00000320270 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.54■■■□□ 2.8
RRS1-201ENST00000320270 CFTRP13569 1480 aa32.4■■■□□ 2.78
RRS1-201ENST00000320270 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.34■■■□□ 2.77
RRS1-201ENST00000320270 PRDM2Q13029 1718 aa32.22■■■□□ 2.75
RRS1-201ENST00000320270 ABCC8Q09428 1581 aa32.16■■■□□ 2.74
RRS1-201ENST00000320270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.16■■■□□ 2.74
RRS1-201ENST00000320270 TRIM41Q8WV44 630 aa32.15■■■□□ 2.74
RRS1-201ENST00000320270 NESP48681 1621 aa32.09■■■□□ 2.73
RRS1-201ENST00000320270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.04■■■□□ 2.72
RRS1-201ENST00000320270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.96■■■□□ 2.71
RRS1-201ENST00000320270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.92■■■□□ 2.7
RRS1-201ENST00000320270 SYNJ1O43426 1573 aa31.9■■■□□ 2.7
RRS1-201ENST00000320270 TOP2BQ02880 1626 aa31.83■■■□□ 2.69
RRS1-201ENST00000320270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.81■■■□□ 2.68
RRS1-201ENST00000320270 CUX1P39880 1505 aa31.81■■■□□ 2.68
RRS1-201ENST00000320270 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.8■■■□□ 2.68
RRS1-201ENST00000320270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.73■■■□□ 2.67
RRS1-201ENST00000320270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.64■■■□□ 2.66
RRS1-201ENST00000320270 TOPBP1Q92547 1522 aa31.59■■■□□ 2.65
RRS1-201ENST00000320270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
RRS1-201ENST00000320270 SOGA1O94964 1423 aa31.51■■■□□ 2.63
RRS1-201ENST00000320270 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.5■■■□□ 2.63
RRS1-201ENST00000320270 ERCC6Q03468 1493 aa31.5■■■□□ 2.63
RRS1-201ENST00000320270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.5■■■□□ 2.63
RRS1-201ENST00000320270 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
RRS1-201ENST00000320270 EEA1Q15075 1411 aa31.47■■■□□ 2.63
RRS1-201ENST00000320270 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
RRS1-201ENST00000320270 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.39■■■□□ 2.61
RRS1-201ENST00000320270 WDR62O43379 1518 aa31.35■■■□□ 2.61
RRS1-201ENST00000320270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
RRS1-201ENST00000320270 KIF27Q86VH2 1401 aa31.28■■■□□ 2.6
RRS1-201ENST00000320270 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.28■■■□□ 2.6
RRS1-201ENST00000320270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.27■■■□□ 2.6
RRS1-201ENST00000320270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.25■■■□□ 2.59
RRS1-201ENST00000320270 CUX2O14529 1486 aa31.24■■■□□ 2.59
RRS1-201ENST00000320270 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.23■■■□□ 2.59
RRS1-201ENST00000320270 WDR97A6NE52 1622 aa31.16■■■□□ 2.58
RRS1-201ENST00000320270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
RRS1-201ENST00000320270 IFT140Q96RY7 1462 aa31.08■■■□□ 2.57
RRS1-201ENST00000320270 KIF21BO75037 1637 aa31.04■■■□□ 2.56
RRS1-201ENST00000320270 IGF1RP08069 1367 aa31.03■■■□□ 2.56
RRS1-201ENST00000320270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.01■■■□□ 2.55
RRS1-201ENST00000320270 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
RRS1-201ENST00000320270 PRXQ9BXM0 1461 aa30.99■■■□□ 2.55
RRS1-201ENST00000320270 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.98■■■□□ 2.55
RRS1-201ENST00000320270 GOLGA3Q08378 1498 aa30.97■■■□□ 2.55
RRS1-201ENST00000320270 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.96■■■□□ 2.55
RRS1-201ENST00000320270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.91■■■□□ 2.54
RRS1-201ENST00000320270 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.88■■■□□ 2.53
RRS1-201ENST00000320270 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.86■■■□□ 2.53
RRS1-201ENST00000320270 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
RRS1-201ENST00000320270 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
RRS1-201ENST00000320270 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.84■■■□□ 2.53
RRS1-201ENST00000320270 CUL7Q14999 1698 aa30.83■■■□□ 2.53
RRS1-201ENST00000320270 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
RRS1-201ENST00000320270 PBRM1Q86U86 1689 aa30.79■■■□□ 2.52
RRS1-201ENST00000320270 GRIN2BQ13224 1484 aa30.78■■■□□ 2.52
RRS1-201ENST00000320270 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
RRS1-201ENST00000320270 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.64■■■□□ 2.5
RRS1-201ENST00000320270 ADAMTS12P58397 1594 aa30.62■■■□□ 2.49
RRS1-201ENST00000320270 CEP162Q5TB80 1403 aa30.61■■■□□ 2.49
RRS1-201ENST00000320270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.58■■■□□ 2.49
RRS1-201ENST00000320270 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
RRS1-201ENST00000320270 CLIP1P30622 1438 aa30.46■■■□□ 2.47
RRS1-201ENST00000320270 SYNJ2O15056 1496 aa30.44■■■□□ 2.46
RRS1-201ENST00000320270 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.42■■■□□ 2.46
RRS1-201ENST00000320270 GRIN2AQ12879 1464 aa30.39■■■□□ 2.46
RRS1-201ENST00000320270 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
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