Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPQ12770 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SCAPQ12770 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAPQ12770 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPQ12770 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAPQ12770 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCAPQ12770 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAPQ12770 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAPQ12770 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAPQ12770 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAPQ12770 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAPQ12770 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAPQ12770 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAPQ12770 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPQ12770 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAPQ12770 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPQ12770 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPQ12770 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCAPQ12770 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCAPQ12770 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCAPQ12770 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCAPQ12770 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPQ12770 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCAPQ12770 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPQ12770 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPQ12770 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SCAPQ12770 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCAPQ12770 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPQ12770 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAPQ12770 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SCAPQ12770 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SCAPQ12770 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCAPQ12770 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCAPQ12770 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPQ12770 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCAPQ12770 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SCAPQ12770 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCAPQ12770 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCAPQ12770 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCAPQ12770 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCAPQ12770 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPQ12770 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPQ12770 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPQ12770 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCAPQ12770 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCAPQ12770 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCAPQ12770 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCAPQ12770 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SCAPQ12770 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPQ12770 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPQ12770 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPQ12770 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCAPQ12770 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SCAPQ12770 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPQ12770 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SCAPQ12770 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SCAPQ12770 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SCAPQ12770 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SCAPQ12770 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPQ12770 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPQ12770 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCAPQ12770 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SCAPQ12770 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCAPQ12770 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCAPQ12770 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCAPQ12770 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPQ12770 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPQ12770 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPQ12770 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPQ12770 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPQ12770 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPQ12770 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPQ12770 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAPQ12770 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPQ12770 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPQ12770 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPQ12770 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPQ12770 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPQ12770 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPQ12770 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SCAPQ12770 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCAPQ12770 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SCAPQ12770 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAPQ12770 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPQ12770 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPQ12770 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPQ12770 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCAPQ12770 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCAPQ12770 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCAPQ12770 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCAPQ12770 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPQ12770 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPQ12770 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPQ12770 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPQ12770 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPQ12770 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPQ12770 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCAPQ12770 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCAPQ12770 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPQ12770 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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