Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PUDPQ08623 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PUDPQ08623 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PUDPQ08623 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PUDPQ08623 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PUDPQ08623 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PUDPQ08623 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PUDPQ08623 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUDPQ08623 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUDPQ08623 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PUDPQ08623 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUDPQ08623 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PUDPQ08623 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PUDPQ08623 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PUDPQ08623 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PUDPQ08623 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PUDPQ08623 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUDPQ08623 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PUDPQ08623 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PUDPQ08623 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUDPQ08623 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUDPQ08623 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUDPQ08623 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUDPQ08623 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUDPQ08623 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PUDPQ08623 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUDPQ08623 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUDPQ08623 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUDPQ08623 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUDPQ08623 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PUDPQ08623 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUDPQ08623 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUDPQ08623 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PUDPQ08623 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PUDPQ08623 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUDPQ08623 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUDPQ08623 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUDPQ08623 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUDPQ08623 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUDPQ08623 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUDPQ08623 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUDPQ08623 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUDPQ08623 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUDPQ08623 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PUDPQ08623 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUDPQ08623 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PUDPQ08623 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PUDPQ08623 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PUDPQ08623 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUDPQ08623 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PUDPQ08623 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PUDPQ08623 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PUDPQ08623 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PUDPQ08623 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUDPQ08623 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUDPQ08623 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUDPQ08623 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUDPQ08623 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUDPQ08623 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUDPQ08623 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUDPQ08623 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUDPQ08623 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUDPQ08623 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUDPQ08623 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUDPQ08623 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUDPQ08623 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUDPQ08623 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUDPQ08623 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUDPQ08623 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUDPQ08623 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUDPQ08623 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUDPQ08623 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUDPQ08623 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PUDPQ08623 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PUDPQ08623 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PUDPQ08623 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUDPQ08623 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUDPQ08623 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUDPQ08623 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUDPQ08623 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PUDPQ08623 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUDPQ08623 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PUDPQ08623 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PUDPQ08623 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUDPQ08623 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUDPQ08623 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUDPQ08623 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUDPQ08623 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PUDPQ08623 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUDPQ08623 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUDPQ08623 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PUDPQ08623 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUDPQ08623 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PUDPQ08623 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUDPQ08623 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUDPQ08623 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PUDPQ08623 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PUDPQ08623 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUDPQ08623 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PUDPQ08623 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms