Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRTAP1-1Q07627 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRTAP1-1Q07627 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRTAP1-1Q07627 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRTAP1-1Q07627 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRTAP1-1Q07627 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRTAP1-1Q07627 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRTAP1-1Q07627 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRTAP1-1Q07627 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRTAP1-1Q07627 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRTAP1-1Q07627 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRTAP1-1Q07627 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRTAP1-1Q07627 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRTAP1-1Q07627 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRTAP1-1Q07627 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRTAP1-1Q07627 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRTAP1-1Q07627 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRTAP1-1Q07627 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRTAP1-1Q07627 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRTAP1-1Q07627 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRTAP1-1Q07627 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRTAP1-1Q07627 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRTAP1-1Q07627 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRTAP1-1Q07627 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRTAP1-1Q07627 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRTAP1-1Q07627 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRTAP1-1Q07627 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRTAP1-1Q07627 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRTAP1-1Q07627 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRTAP1-1Q07627 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRTAP1-1Q07627 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRTAP1-1Q07627 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRTAP1-1Q07627 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRTAP1-1Q07627 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRTAP1-1Q07627 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRTAP1-1Q07627 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRTAP1-1Q07627 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRTAP1-1Q07627 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRTAP1-1Q07627 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRTAP1-1Q07627 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRTAP1-1Q07627 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRTAP1-1Q07627 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRTAP1-1Q07627 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRTAP1-1Q07627 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRTAP1-1Q07627 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRTAP1-1Q07627 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRTAP1-1Q07627 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRTAP1-1Q07627 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRTAP1-1Q07627 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRTAP1-1Q07627 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRTAP1-1Q07627 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRTAP1-1Q07627 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRTAP1-1Q07627 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRTAP1-1Q07627 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRTAP1-1Q07627 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRTAP1-1Q07627 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRTAP1-1Q07627 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRTAP1-1Q07627 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRTAP1-1Q07627 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRTAP1-1Q07627 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRTAP1-1Q07627 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRTAP1-1Q07627 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRTAP1-1Q07627 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRTAP1-1Q07627 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRTAP1-1Q07627 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRTAP1-1Q07627 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRTAP1-1Q07627 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRTAP1-1Q07627 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRTAP1-1Q07627 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRTAP1-1Q07627 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRTAP1-1Q07627 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP1-1Q07627 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRTAP1-1Q07627 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRTAP1-1Q07627 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRTAP1-1Q07627 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRTAP1-1Q07627 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRTAP1-1Q07627 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP1-1Q07627 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP1-1Q07627 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP1-1Q07627 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP1-1Q07627 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRTAP1-1Q07627 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRTAP1-1Q07627 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTAP1-1Q07627 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTAP1-1Q07627 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRTAP1-1Q07627 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRTAP1-1Q07627 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRTAP1-1Q07627 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRTAP1-1Q07627 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRTAP1-1Q07627 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRTAP1-1Q07627 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRTAP1-1Q07627 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRTAP1-1Q07627 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRTAP1-1Q07627 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTAP1-1Q07627 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTAP1-1Q07627 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTAP1-1Q07627 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTAP1-1Q07627 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTAP1-1Q07627 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms