Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRTAP1-1Q07627 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRTAP1-1Q07627 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRTAP1-1Q07627 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRTAP1-1Q07627 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRTAP1-1Q07627 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRTAP1-1Q07627 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTAP1-1Q07627 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTAP1-1Q07627 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP1-1Q07627 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRTAP1-1Q07627 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTAP1-1Q07627 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTAP1-1Q07627 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTAP1-1Q07627 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTAP1-1Q07627 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTAP1-1Q07627 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTAP1-1Q07627 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTAP1-1Q07627 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTAP1-1Q07627 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTAP1-1Q07627 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTAP1-1Q07627 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTAP1-1Q07627 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP1-1Q07627 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRTAP1-1Q07627 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRTAP1-1Q07627 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRTAP1-1Q07627 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRTAP1-1Q07627 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRTAP1-1Q07627 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTAP1-1Q07627 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTAP1-1Q07627 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTAP1-1Q07627 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTAP1-1Q07627 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTAP1-1Q07627 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRTAP1-1Q07627 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRTAP1-1Q07627 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRTAP1-1Q07627 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRTAP1-1Q07627 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRTAP1-1Q07627 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRTAP1-1Q07627 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRTAP1-1Q07627 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRTAP1-1Q07627 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRTAP1-1Q07627 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRTAP1-1Q07627 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRTAP1-1Q07627 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRTAP1-1Q07627 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRTAP1-1Q07627 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRTAP1-1Q07627 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRTAP1-1Q07627 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRTAP1-1Q07627 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRTAP1-1Q07627 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRTAP1-1Q07627 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRTAP1-1Q07627 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRTAP1-1Q07627 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP1-1Q07627 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP1-1Q07627 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRTAP1-1Q07627 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRTAP1-1Q07627 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRTAP1-1Q07627 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRTAP1-1Q07627 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRTAP1-1Q07627 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP1-1Q07627 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP1-1Q07627 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRTAP1-1Q07627 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRTAP1-1Q07627 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRTAP1-1Q07627 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRTAP1-1Q07627 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRTAP1-1Q07627 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRTAP1-1Q07627 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRTAP1-1Q07627 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRTAP1-1Q07627 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRTAP1-1Q07627 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP1-1Q07627 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP1-1Q07627 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP1-1Q07627 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP1-1Q07627 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP1-1Q07627 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRTAP1-1Q07627 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRTAP1-1Q07627 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP1-1Q07627 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP1-1Q07627 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRTAP1-1Q07627 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRTAP1-1Q07627 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRTAP1-1Q07627 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP1-1Q07627 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP1-1Q07627 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP1-1Q07627 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms