Protein–RNA interactions for Protein: Q05925

EN1, Homeobox protein engrailed-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EN1Q05925 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.91
EN1Q05925 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
EN1Q05925 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.22■■■■■ 4.83
EN1Q05925 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
EN1Q05925 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
EN1Q05925 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
EN1Q05925 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
EN1Q05925 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
EN1Q05925 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
EN1Q05925 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
EN1Q05925 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
EN1Q05925 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
EN1Q05925 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
EN1Q05925 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
EN1Q05925 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
EN1Q05925 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
EN1Q05925 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
EN1Q05925 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
EN1Q05925 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
EN1Q05925 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
EN1Q05925 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
EN1Q05925 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
EN1Q05925 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
EN1Q05925 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
EN1Q05925 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
EN1Q05925 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
EN1Q05925 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
EN1Q05925 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
EN1Q05925 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
EN1Q05925 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
EN1Q05925 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
EN1Q05925 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
EN1Q05925 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
EN1Q05925 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
EN1Q05925 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
EN1Q05925 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
EN1Q05925 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
EN1Q05925 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
EN1Q05925 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
EN1Q05925 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
EN1Q05925 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
EN1Q05925 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
EN1Q05925 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
EN1Q05925 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
EN1Q05925 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
EN1Q05925 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
EN1Q05925 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
EN1Q05925 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
EN1Q05925 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
EN1Q05925 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
EN1Q05925 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
EN1Q05925 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
EN1Q05925 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
EN1Q05925 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
EN1Q05925 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
EN1Q05925 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
EN1Q05925 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
EN1Q05925 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
EN1Q05925 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
EN1Q05925 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
EN1Q05925 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
EN1Q05925 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
EN1Q05925 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
EN1Q05925 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
EN1Q05925 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
EN1Q05925 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
EN1Q05925 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
EN1Q05925 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
EN1Q05925 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
EN1Q05925 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
EN1Q05925 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
EN1Q05925 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
EN1Q05925 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
EN1Q05925 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
EN1Q05925 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
EN1Q05925 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
EN1Q05925 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
EN1Q05925 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
EN1Q05925 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
EN1Q05925 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
EN1Q05925 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
EN1Q05925 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
EN1Q05925 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
EN1Q05925 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
EN1Q05925 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
EN1Q05925 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
EN1Q05925 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
EN1Q05925 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
EN1Q05925 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
EN1Q05925 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
EN1Q05925 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
EN1Q05925 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
EN1Q05925 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
EN1Q05925 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
EN1Q05925 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
EN1Q05925 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
EN1Q05925 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
EN1Q05925 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
EN1Q05925 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
EN1Q05925 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms