Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.91■■■■■ 7.02
TOP2BQ02880 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.19■■■■■ 6.91
TOP2BQ02880 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.46■■■■■ 6.79
TOP2BQ02880 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.32■■■■■ 6.77
TOP2BQ02880 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57■■■■■ 6.72
TOP2BQ02880 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.73■■■■■ 6.67
TOP2BQ02880 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.64■■■■■ 6.66
TOP2BQ02880 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.34■■■■■ 6.61
TOP2BQ02880 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.63■■■■■ 6.5
TOP2BQ02880 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC55.46■■■■■ 6.47
TOP2BQ02880 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.46■■■■■ 6.47
TOP2BQ02880 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.43■■■■■ 6.46
TOP2BQ02880 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.07■■■■■ 6.41
TOP2BQ02880 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.05■■■■■ 6.4
TOP2BQ02880 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.02■■■■■ 6.4
TOP2BQ02880 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.85■■■■■ 6.37
TOP2BQ02880 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.73■■■■■ 6.35
TOP2BQ02880 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC54.62■■■■■ 6.33
TOP2BQ02880 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.33
TOP2BQ02880 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.34■■■■■ 6.29
TOP2BQ02880 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.1■■■■■ 6.25
TOP2BQ02880 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.06■■■■■ 6.25
TOP2BQ02880 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.05■■■■■ 6.24
TOP2BQ02880 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
TOP2BQ02880 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
TOP2BQ02880 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC53.75■■■■■ 6.19
TOP2BQ02880 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
TOP2BQ02880 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.64■■■■■ 6.18
TOP2BQ02880 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.39■■■■■ 6.14
TOP2BQ02880 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.38■■■■■ 6.14
TOP2BQ02880 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
TOP2BQ02880 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.27■■■■■ 6.12
TOP2BQ02880 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
TOP2BQ02880 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.93■■■■■ 6.06
TOP2BQ02880 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.88■■■■■ 6.05
TOP2BQ02880 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.8■■■■■ 6.04
TOP2BQ02880 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.68■■■■■ 6.02
TOP2BQ02880 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.58■■■■■ 6.01
TOP2BQ02880 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.53■■■■■ 6
TOP2BQ02880 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
TOP2BQ02880 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.24■■■■■ 5.95
TOP2BQ02880 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
TOP2BQ02880 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC52.09■■■■■ 5.93
TOP2BQ02880 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
TOP2BQ02880 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
TOP2BQ02880 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
TOP2BQ02880 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
TOP2BQ02880 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
TOP2BQ02880 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.74■■■■■ 5.87
TOP2BQ02880 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.64■■■■■ 5.86
TOP2BQ02880 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
TOP2BQ02880 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.31■■■■■ 5.81
TOP2BQ02880 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.31■■■■■ 5.8
TOP2BQ02880 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
TOP2BQ02880 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.27■■■■■ 5.8
TOP2BQ02880 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
TOP2BQ02880 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
TOP2BQ02880 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
TOP2BQ02880 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
TOP2BQ02880 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
TOP2BQ02880 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
TOP2BQ02880 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
TOP2BQ02880 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.91■■■■■ 5.74
TOP2BQ02880 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
TOP2BQ02880 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.91■■■■■ 5.74
TOP2BQ02880 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
TOP2BQ02880 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.85■■■■■ 5.73
TOP2BQ02880 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.83■■■■■ 5.73
TOP2BQ02880 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
TOP2BQ02880 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
TOP2BQ02880 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.76■■■■■ 5.72
TOP2BQ02880 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.68■■■■■ 5.7
TOP2BQ02880 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
TOP2BQ02880 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC50.61■■■■■ 5.69
TOP2BQ02880 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.61■■■■■ 5.69
TOP2BQ02880 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.61■■■■■ 5.69
TOP2BQ02880 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
TOP2BQ02880 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.58■■■■■ 5.69
TOP2BQ02880 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
TOP2BQ02880 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC50.57■■■■■ 5.69
TOP2BQ02880 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.48■■■■■ 5.67
TOP2BQ02880 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.47■■■■■ 5.67
TOP2BQ02880 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.47■■■■■ 5.67
TOP2BQ02880 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
TOP2BQ02880 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.42■■■■■ 5.66
TOP2BQ02880 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.42■■■■■ 5.66
TOP2BQ02880 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
TOP2BQ02880 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
TOP2BQ02880 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.37■■■■■ 5.65
TOP2BQ02880 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
TOP2BQ02880 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
TOP2BQ02880 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.32■■■■■ 5.65
TOP2BQ02880 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
TOP2BQ02880 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
TOP2BQ02880 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
TOP2BQ02880 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.06■■■■■ 5.6
TOP2BQ02880 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC50.04■■■■■ 5.6
TOP2BQ02880 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
TOP2BQ02880 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC49.96■■■■■ 5.59
TOP2BQ02880 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.93■■■■■ 5.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms