Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PLCB3Q01970 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PLCB3Q01970 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PLCB3Q01970 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PLCB3Q01970 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLCB3Q01970 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PLCB3Q01970 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PLCB3Q01970 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PLCB3Q01970 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLCB3Q01970 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PLCB3Q01970 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PLCB3Q01970 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PLCB3Q01970 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PLCB3Q01970 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PLCB3Q01970 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PLCB3Q01970 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PLCB3Q01970 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PLCB3Q01970 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PLCB3Q01970 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PLCB3Q01970 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PLCB3Q01970 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PLCB3Q01970 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLCB3Q01970 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLCB3Q01970 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLCB3Q01970 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLCB3Q01970 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLCB3Q01970 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLCB3Q01970 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLCB3Q01970 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLCB3Q01970 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PLCB3Q01970 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLCB3Q01970 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLCB3Q01970 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLCB3Q01970 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLCB3Q01970 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PLCB3Q01970 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PLCB3Q01970 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PLCB3Q01970 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PLCB3Q01970 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PLCB3Q01970 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PLCB3Q01970 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PLCB3Q01970 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PLCB3Q01970 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PLCB3Q01970 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PLCB3Q01970 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PLCB3Q01970 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PLCB3Q01970 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PLCB3Q01970 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PLCB3Q01970 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PLCB3Q01970 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PLCB3Q01970 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PLCB3Q01970 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PLCB3Q01970 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PLCB3Q01970 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PLCB3Q01970 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PLCB3Q01970 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PLCB3Q01970 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PLCB3Q01970 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PLCB3Q01970 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PLCB3Q01970 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PLCB3Q01970 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PLCB3Q01970 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PLCB3Q01970 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLCB3Q01970 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PLCB3Q01970 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PLCB3Q01970 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLCB3Q01970 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLCB3Q01970 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLCB3Q01970 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PLCB3Q01970 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PLCB3Q01970 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PLCB3Q01970 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PLCB3Q01970 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PLCB3Q01970 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PLCB3Q01970 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PLCB3Q01970 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PLCB3Q01970 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PLCB3Q01970 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PLCB3Q01970 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PLCB3Q01970 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PLCB3Q01970 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PLCB3Q01970 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PLCB3Q01970 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PLCB3Q01970 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PLCB3Q01970 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PLCB3Q01970 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PLCB3Q01970 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PLCB3Q01970 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PLCB3Q01970 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PLCB3Q01970 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PLCB3Q01970 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PLCB3Q01970 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms