Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.32■■■■■ 5.49
PIP4K2BP78356 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.91■■■■■ 5.42
PIP4K2BP78356 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.51■■■■■ 5.36
PIP4K2BP78356 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
PIP4K2BP78356 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
PIP4K2BP78356 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
PIP4K2BP78356 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
PIP4K2BP78356 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
PIP4K2BP78356 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.1■■■■■ 5.13
PIP4K2BP78356 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
PIP4K2BP78356 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
PIP4K2BP78356 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
PIP4K2BP78356 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.41■■■■■ 5.02
PIP4K2BP78356 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
PIP4K2BP78356 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
PIP4K2BP78356 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
PIP4K2BP78356 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
PIP4K2BP78356 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
PIP4K2BP78356 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
PIP4K2BP78356 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
PIP4K2BP78356 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
PIP4K2BP78356 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
PIP4K2BP78356 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
PIP4K2BP78356 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
PIP4K2BP78356 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
PIP4K2BP78356 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
PIP4K2BP78356 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
PIP4K2BP78356 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
PIP4K2BP78356 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
PIP4K2BP78356 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
PIP4K2BP78356 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
PIP4K2BP78356 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
PIP4K2BP78356 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
PIP4K2BP78356 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
PIP4K2BP78356 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
PIP4K2BP78356 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
PIP4K2BP78356 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
PIP4K2BP78356 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
PIP4K2BP78356 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PIP4K2BP78356 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
PIP4K2BP78356 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
PIP4K2BP78356 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
PIP4K2BP78356 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
PIP4K2BP78356 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
PIP4K2BP78356 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
PIP4K2BP78356 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PIP4K2BP78356 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
PIP4K2BP78356 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
PIP4K2BP78356 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
PIP4K2BP78356 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.7■■■■■ 4.59
PIP4K2BP78356 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PIP4K2BP78356 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PIP4K2BP78356 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PIP4K2BP78356 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
PIP4K2BP78356 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PIP4K2BP78356 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
PIP4K2BP78356 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PIP4K2BP78356 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PIP4K2BP78356 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
PIP4K2BP78356 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
PIP4K2BP78356 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PIP4K2BP78356 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
PIP4K2BP78356 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PIP4K2BP78356 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
PIP4K2BP78356 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
PIP4K2BP78356 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
PIP4K2BP78356 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PIP4K2BP78356 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PIP4K2BP78356 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PIP4K2BP78356 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PIP4K2BP78356 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PIP4K2BP78356 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
PIP4K2BP78356 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
PIP4K2BP78356 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
PIP4K2BP78356 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PIP4K2BP78356 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PIP4K2BP78356 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PIP4K2BP78356 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
PIP4K2BP78356 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PIP4K2BP78356 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PIP4K2BP78356 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PIP4K2BP78356 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PIP4K2BP78356 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PIP4K2BP78356 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
PIP4K2BP78356 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PIP4K2BP78356 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
PIP4K2BP78356 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
PIP4K2BP78356 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
PIP4K2BP78356 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
PIP4K2BP78356 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PIP4K2BP78356 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PIP4K2BP78356 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PIP4K2BP78356 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PIP4K2BP78356 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PIP4K2BP78356 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PIP4K2BP78356 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
PIP4K2BP78356 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
PIP4K2BP78356 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PIP4K2BP78356 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
PIP4K2BP78356 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms