Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SNRPD1P62314 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SNRPD1P62314 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SNRPD1P62314 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SNRPD1P62314 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SNRPD1P62314 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNRPD1P62314 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNRPD1P62314 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SNRPD1P62314 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNRPD1P62314 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SNRPD1P62314 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRPD1P62314 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SNRPD1P62314 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNRPD1P62314 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SNRPD1P62314 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNRPD1P62314 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SNRPD1P62314 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SNRPD1P62314 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SNRPD1P62314 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNRPD1P62314 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SNRPD1P62314 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNRPD1P62314 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SNRPD1P62314 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SNRPD1P62314 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SNRPD1P62314 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SNRPD1P62314 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SNRPD1P62314 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SNRPD1P62314 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SNRPD1P62314 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNRPD1P62314 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNRPD1P62314 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SNRPD1P62314 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SNRPD1P62314 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNRPD1P62314 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNRPD1P62314 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNRPD1P62314 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNRPD1P62314 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNRPD1P62314 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SNRPD1P62314 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNRPD1P62314 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNRPD1P62314 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNRPD1P62314 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SNRPD1P62314 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SNRPD1P62314 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNRPD1P62314 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNRPD1P62314 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNRPD1P62314 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SNRPD1P62314 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNRPD1P62314 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNRPD1P62314 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNRPD1P62314 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNRPD1P62314 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNRPD1P62314 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNRPD1P62314 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNRPD1P62314 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SNRPD1P62314 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SNRPD1P62314 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNRPD1P62314 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNRPD1P62314 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNRPD1P62314 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SNRPD1P62314 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNRPD1P62314 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNRPD1P62314 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNRPD1P62314 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNRPD1P62314 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNRPD1P62314 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNRPD1P62314 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNRPD1P62314 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SNRPD1P62314 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNRPD1P62314 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNRPD1P62314 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNRPD1P62314 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNRPD1P62314 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNRPD1P62314 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNRPD1P62314 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNRPD1P62314 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNRPD1P62314 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNRPD1P62314 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNRPD1P62314 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNRPD1P62314 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNRPD1P62314 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNRPD1P62314 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNRPD1P62314 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNRPD1P62314 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNRPD1P62314 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNRPD1P62314 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNRPD1P62314 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNRPD1P62314 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNRPD1P62314 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNRPD1P62314 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNRPD1P62314 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SNRPD1P62314 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNRPD1P62314 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNRPD1P62314 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNRPD1P62314 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNRPD1P62314 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNRPD1P62314 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNRPD1P62314 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNRPD1P62314 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNRPD1P62314 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms