Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLDN17P56750 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLDN17P56750 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLDN17P56750 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLDN17P56750 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLDN17P56750 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLDN17P56750 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLDN17P56750 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLDN17P56750 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLDN17P56750 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLDN17P56750 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLDN17P56750 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLDN17P56750 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLDN17P56750 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLDN17P56750 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLDN17P56750 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLDN17P56750 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLDN17P56750 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLDN17P56750 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLDN17P56750 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLDN17P56750 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDN17P56750 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN17P56750 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLDN17P56750 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN17P56750 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLDN17P56750 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN17P56750 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLDN17P56750 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN17P56750 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CLDN17P56750 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN17P56750 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN17P56750 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN17P56750 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN17P56750 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN17P56750 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN17P56750 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN17P56750 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN17P56750 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN17P56750 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN17P56750 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN17P56750 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN17P56750 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN17P56750 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN17P56750 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN17P56750 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN17P56750 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN17P56750 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN17P56750 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN17P56750 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN17P56750 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN17P56750 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLDN17P56750 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLDN17P56750 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN17P56750 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN17P56750 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN17P56750 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN17P56750 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN17P56750 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN17P56750 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN17P56750 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN17P56750 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN17P56750 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN17P56750 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN17P56750 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLDN17P56750 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN17P56750 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN17P56750 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDN17P56750 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDN17P56750 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDN17P56750 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDN17P56750 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDN17P56750 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDN17P56750 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDN17P56750 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDN17P56750 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN17P56750 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN17P56750 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN17P56750 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN17P56750 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN17P56750 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN17P56750 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN17P56750 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN17P56750 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN17P56750 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN17P56750 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN17P56750 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN17P56750 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN17P56750 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN17P56750 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN17P56750 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN17P56750 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN17P56750 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN17P56750 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN17P56750 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN17P56750 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN17P56750 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN17P56750 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN17P56750 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN17P56750 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN17P56750 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms