Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SOX10P56693 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SOX10P56693 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SOX10P56693 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SOX10P56693 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SOX10P56693 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SOX10P56693 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SOX10P56693 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SOX10P56693 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SOX10P56693 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SOX10P56693 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SOX10P56693 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SOX10P56693 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SOX10P56693 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SOX10P56693 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SOX10P56693 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SOX10P56693 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SOX10P56693 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SOX10P56693 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SOX10P56693 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SOX10P56693 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SOX10P56693 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SOX10P56693 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SOX10P56693 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SOX10P56693 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SOX10P56693 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SOX10P56693 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SOX10P56693 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SOX10P56693 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SOX10P56693 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SOX10P56693 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SOX10P56693 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SOX10P56693 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SOX10P56693 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SOX10P56693 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SOX10P56693 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SOX10P56693 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SOX10P56693 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SOX10P56693 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SOX10P56693 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SOX10P56693 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SOX10P56693 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SOX10P56693 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SOX10P56693 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SOX10P56693 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SOX10P56693 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SOX10P56693 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SOX10P56693 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SOX10P56693 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SOX10P56693 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SOX10P56693 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SOX10P56693 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SOX10P56693 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SOX10P56693 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SOX10P56693 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SOX10P56693 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SOX10P56693 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SOX10P56693 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SOX10P56693 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SOX10P56693 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SOX10P56693 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SOX10P56693 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SOX10P56693 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SOX10P56693 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SOX10P56693 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SOX10P56693 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SOX10P56693 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SOX10P56693 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SOX10P56693 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SOX10P56693 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SOX10P56693 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SOX10P56693 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SOX10P56693 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SOX10P56693 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SOX10P56693 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SOX10P56693 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SOX10P56693 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOX10P56693 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOX10P56693 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SOX10P56693 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SOX10P56693 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SOX10P56693 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SOX10P56693 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SOX10P56693 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SOX10P56693 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SOX10P56693 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SOX10P56693 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SOX10P56693 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SOX10P56693 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SOX10P56693 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SOX10P56693 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SOX10P56693 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SOX10P56693 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SOX10P56693 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SOX10P56693 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SOX10P56693 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SOX10P56693 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SOX10P56693 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SOX10P56693 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SOX10P56693 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms