Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RABGGTBP53611 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RABGGTBP53611 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RABGGTBP53611 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RABGGTBP53611 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RABGGTBP53611 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RABGGTBP53611 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RABGGTBP53611 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RABGGTBP53611 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RABGGTBP53611 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RABGGTBP53611 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
RABGGTBP53611 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RABGGTBP53611 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RABGGTBP53611 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RABGGTBP53611 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RABGGTBP53611 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RABGGTBP53611 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RABGGTBP53611 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RABGGTBP53611 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RABGGTBP53611 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RABGGTBP53611 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RABGGTBP53611 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RABGGTBP53611 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RABGGTBP53611 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RABGGTBP53611 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RABGGTBP53611 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RABGGTBP53611 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RABGGTBP53611 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RABGGTBP53611 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RABGGTBP53611 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RABGGTBP53611 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
RABGGTBP53611 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RABGGTBP53611 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RABGGTBP53611 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RABGGTBP53611 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RABGGTBP53611 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RABGGTBP53611 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
RABGGTBP53611 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RABGGTBP53611 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RABGGTBP53611 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RABGGTBP53611 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RABGGTBP53611 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
RABGGTBP53611 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RABGGTBP53611 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RABGGTBP53611 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RABGGTBP53611 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RABGGTBP53611 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RABGGTBP53611 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RABGGTBP53611 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RABGGTBP53611 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RABGGTBP53611 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RABGGTBP53611 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RABGGTBP53611 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RABGGTBP53611 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RABGGTBP53611 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RABGGTBP53611 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RABGGTBP53611 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RABGGTBP53611 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RABGGTBP53611 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RABGGTBP53611 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RABGGTBP53611 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RABGGTBP53611 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RABGGTBP53611 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RABGGTBP53611 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RABGGTBP53611 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RABGGTBP53611 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RABGGTBP53611 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RABGGTBP53611 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RABGGTBP53611 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RABGGTBP53611 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RABGGTBP53611 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RABGGTBP53611 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RABGGTBP53611 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RABGGTBP53611 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RABGGTBP53611 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RABGGTBP53611 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RABGGTBP53611 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RABGGTBP53611 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RABGGTBP53611 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RABGGTBP53611 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RABGGTBP53611 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RABGGTBP53611 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RABGGTBP53611 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RABGGTBP53611 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RABGGTBP53611 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RABGGTBP53611 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RABGGTBP53611 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RABGGTBP53611 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RABGGTBP53611 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RABGGTBP53611 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RABGGTBP53611 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RABGGTBP53611 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RABGGTBP53611 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
RABGGTBP53611 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RABGGTBP53611 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RABGGTBP53611 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RABGGTBP53611 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
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