Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PSEN2P49810 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PSEN2P49810 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PSEN2P49810 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PSEN2P49810 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PSEN2P49810 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PSEN2P49810 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PSEN2P49810 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PSEN2P49810 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PSEN2P49810 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PSEN2P49810 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PSEN2P49810 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PSEN2P49810 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PSEN2P49810 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PSEN2P49810 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PSEN2P49810 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PSEN2P49810 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PSEN2P49810 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PSEN2P49810 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PSEN2P49810 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PSEN2P49810 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PSEN2P49810 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PSEN2P49810 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PSEN2P49810 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PSEN2P49810 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PSEN2P49810 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PSEN2P49810 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PSEN2P49810 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSEN2P49810 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PSEN2P49810 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PSEN2P49810 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PSEN2P49810 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PSEN2P49810 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PSEN2P49810 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PSEN2P49810 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PSEN2P49810 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PSEN2P49810 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PSEN2P49810 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PSEN2P49810 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PSEN2P49810 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PSEN2P49810 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSEN2P49810 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PSEN2P49810 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PSEN2P49810 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSEN2P49810 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PSEN2P49810 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSEN2P49810 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PSEN2P49810 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PSEN2P49810 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PSEN2P49810 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PSEN2P49810 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PSEN2P49810 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PSEN2P49810 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PSEN2P49810 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSEN2P49810 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSEN2P49810 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSEN2P49810 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PSEN2P49810 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSEN2P49810 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSEN2P49810 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSEN2P49810 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSEN2P49810 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PSEN2P49810 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSEN2P49810 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSEN2P49810 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSEN2P49810 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSEN2P49810 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSEN2P49810 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSEN2P49810 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSEN2P49810 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSEN2P49810 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSEN2P49810 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSEN2P49810 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PSEN2P49810 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSEN2P49810 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSEN2P49810 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSEN2P49810 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSEN2P49810 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSEN2P49810 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSEN2P49810 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSEN2P49810 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSEN2P49810 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSEN2P49810 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSEN2P49810 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PSEN2P49810 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSEN2P49810 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSEN2P49810 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PSEN2P49810 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSEN2P49810 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PSEN2P49810 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSEN2P49810 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSEN2P49810 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSEN2P49810 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSEN2P49810 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSEN2P49810 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSEN2P49810 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSEN2P49810 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PSEN2P49810 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PSEN2P49810 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PSEN2P49810 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms