Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC63.19■■■■■ 7.71
NCAPD3P42695 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC62.86■■■■■ 7.65
NCAPD3P42695 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC62.39■■■■■ 7.58
NCAPD3P42695 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.58■■■■■ 7.45
NCAPD3P42695 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.72■■■■■ 7.31
NCAPD3P42695 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.25■■■■■ 7.24
NCAPD3P42695 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC60.24■■■■■ 7.23
NCAPD3P42695 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC60.07■■■■■ 7.21
NCAPD3P42695 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.06■■■■■ 7.21
NCAPD3P42695 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC59.95■■■■■ 7.19
NCAPD3P42695 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.89■■■■■ 7.18
NCAPD3P42695 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC59.66■■■■■ 7.14
NCAPD3P42695 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC59.58■■■■■ 7.13
NCAPD3P42695 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.41■■■■■ 7.1
NCAPD3P42695 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC59.37■■■■■ 7.09
NCAPD3P42695 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.36■■■■■ 7.09
NCAPD3P42695 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.8■■■■■ 7
NCAPD3P42695 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC58.6■■■■■ 6.97
NCAPD3P42695 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC58.5■■■■■ 6.95
NCAPD3P42695 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.41■■■■■ 6.94
NCAPD3P42695 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.29■■■■■ 6.92
NCAPD3P42695 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC58.29■■■■■ 6.92
NCAPD3P42695 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC58.17■■■■■ 6.9
NCAPD3P42695 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC58.08■■■■■ 6.89
NCAPD3P42695 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.03■■■■■ 6.88
NCAPD3P42695 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58■■■■■ 6.88
NCAPD3P42695 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC57.85■■■■■ 6.85
NCAPD3P42695 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC57.83■■■■■ 6.85
NCAPD3P42695 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC57.76■■■■■ 6.84
NCAPD3P42695 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.61■■■■■ 6.81
NCAPD3P42695 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC57.52■■■■■ 6.8
NCAPD3P42695 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.17■■■■■ 6.74
NCAPD3P42695 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC56.96■■■■■ 6.71
NCAPD3P42695 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC56.95■■■■■ 6.71
NCAPD3P42695 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.88■■■■■ 6.7
NCAPD3P42695 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC56.84■■■■■ 6.69
NCAPD3P42695 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC56.77■■■■■ 6.68
NCAPD3P42695 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC56.38■■■■■ 6.62
NCAPD3P42695 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC56.35■■■■■ 6.61
NCAPD3P42695 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.18■■■■■ 6.58
NCAPD3P42695 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.11■■■■■ 6.57
NCAPD3P42695 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC56.08■■■■■ 6.57
NCAPD3P42695 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.96■■■■■ 6.55
NCAPD3P42695 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC55.93■■■■■ 6.54
NCAPD3P42695 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC55.87■■■■■ 6.53
NCAPD3P42695 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC55.85■■■■■ 6.53
NCAPD3P42695 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.74■■■■■ 6.51
NCAPD3P42695 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC55.69■■■■■ 6.51
NCAPD3P42695 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC55.69■■■■■ 6.51
NCAPD3P42695 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.65■■■■■ 6.5
NCAPD3P42695 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.64■■■■■ 6.5
NCAPD3P42695 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC55.61■■■■■ 6.49
NCAPD3P42695 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC55.56■■■■■ 6.48
NCAPD3P42695 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC55.53■■■■■ 6.48
NCAPD3P42695 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC55.46■■■■■ 6.47
NCAPD3P42695 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC55.45■■■■■ 6.47
NCAPD3P42695 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC55.43■■■■■ 6.46
NCAPD3P42695 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC55.29■■■■■ 6.44
NCAPD3P42695 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.25■■■■■ 6.44
NCAPD3P42695 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.21■■■■■ 6.43
NCAPD3P42695 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC55.13■■■■■ 6.42
NCAPD3P42695 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.13■■■■■ 6.42
NCAPD3P42695 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.04■■■■■ 6.4
NCAPD3P42695 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC55.01■■■■■ 6.4
NCAPD3P42695 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.99■■■■■ 6.39
NCAPD3P42695 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
NCAPD3P42695 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
NCAPD3P42695 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC54.94■■■■■ 6.39
NCAPD3P42695 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC54.92■■■■■ 6.38
NCAPD3P42695 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.8■■■■■ 6.36
NCAPD3P42695 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC54.7■■■■■ 6.35
NCAPD3P42695 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.7■■■■■ 6.35
NCAPD3P42695 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.62■■■■■ 6.33
NCAPD3P42695 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC54.62■■■■■ 6.33
NCAPD3P42695 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC54.56■■■■■ 6.32
NCAPD3P42695 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.44■■■■■ 6.31
NCAPD3P42695 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
NCAPD3P42695 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC54.42■■■■■ 6.3
NCAPD3P42695 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC54.41■■■■■ 6.3
NCAPD3P42695 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
NCAPD3P42695 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.4■■■■■ 6.3
NCAPD3P42695 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC54.4■■■■■ 6.3
NCAPD3P42695 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
NCAPD3P42695 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC54.36■■■■■ 6.29
NCAPD3P42695 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.29
NCAPD3P42695 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.31■■■■■ 6.28
NCAPD3P42695 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC54.26■■■■■ 6.28
NCAPD3P42695 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.25■■■■■ 6.27
NCAPD3P42695 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC54.17■■■■■ 6.26
NCAPD3P42695 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
NCAPD3P42695 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC54.15■■■■■ 6.26
NCAPD3P42695 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC54.15■■■■■ 6.26
NCAPD3P42695 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC54.14■■■■■ 6.26
NCAPD3P42695 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC54.12■■■■■ 6.25
NCAPD3P42695 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC54.12■■■■■ 6.25
NCAPD3P42695 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC54.12■■■■■ 6.25
NCAPD3P42695 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
NCAPD3P42695 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.05■■■■■ 6.24
NCAPD3P42695 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
NCAPD3P42695 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.01■■■■■ 6.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms