Protein–RNA interactions for Protein: P31358

CD52, CAMPATH-1 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD52P31358 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CD52P31358 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CD52P31358 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CD52P31358 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CD52P31358 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CD52P31358 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CD52P31358 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CD52P31358 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CD52P31358 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CD52P31358 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD52P31358 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CD52P31358 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CD52P31358 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CD52P31358 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CD52P31358 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CD52P31358 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CD52P31358 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CD52P31358 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CD52P31358 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CD52P31358 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CD52P31358 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CD52P31358 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CD52P31358 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CD52P31358 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CD52P31358 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CD52P31358 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CD52P31358 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CD52P31358 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CD52P31358 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD52P31358 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD52P31358 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CD52P31358 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CD52P31358 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CD52P31358 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CD52P31358 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CD52P31358 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CD52P31358 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CD52P31358 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CD52P31358 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CD52P31358 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CD52P31358 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CD52P31358 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CD52P31358 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CD52P31358 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CD52P31358 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CD52P31358 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CD52P31358 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD52P31358 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CD52P31358 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CD52P31358 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CD52P31358 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD52P31358 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CD52P31358 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CD52P31358 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CD52P31358 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CD52P31358 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CD52P31358 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CD52P31358 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CD52P31358 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD52P31358 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CD52P31358 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CD52P31358 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CD52P31358 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CD52P31358 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CD52P31358 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CD52P31358 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CD52P31358 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CD52P31358 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CD52P31358 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CD52P31358 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CD52P31358 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CD52P31358 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CD52P31358 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CD52P31358 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CD52P31358 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CD52P31358 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CD52P31358 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CD52P31358 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CD52P31358 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CD52P31358 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CD52P31358 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CD52P31358 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CD52P31358 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CD52P31358 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CD52P31358 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CD52P31358 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CD52P31358 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CD52P31358 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CD52P31358 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CD52P31358 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CD52P31358 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CD52P31358 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CD52P31358 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CD52P31358 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CD52P31358 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CD52P31358 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD52P31358 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD52P31358 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CD52P31358 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD52P31358 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms