Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.04■■■■■ 5.6
CPS1P31327 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.5■■■■■ 5.51
CPS1P31327 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.26■■■■■ 5.48
CPS1P31327 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
CPS1P31327 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
CPS1P31327 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
CPS1P31327 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
CPS1P31327 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
CPS1P31327 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.69■■■■■ 5.22
CPS1P31327 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
CPS1P31327 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CPS1P31327 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
CPS1P31327 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CPS1P31327 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
CPS1P31327 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
CPS1P31327 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CPS1P31327 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.74■■■■■ 5.07
CPS1P31327 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
CPS1P31327 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CPS1P31327 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CPS1P31327 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CPS1P31327 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.97
CPS1P31327 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
CPS1P31327 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
CPS1P31327 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
CPS1P31327 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.91■■■■■ 4.94
CPS1P31327 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
CPS1P31327 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CPS1P31327 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
CPS1P31327 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
CPS1P31327 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
CPS1P31327 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CPS1P31327 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CPS1P31327 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CPS1P31327 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CPS1P31327 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
CPS1P31327 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
CPS1P31327 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CPS1P31327 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CPS1P31327 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CPS1P31327 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
CPS1P31327 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CPS1P31327 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
CPS1P31327 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CPS1P31327 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CPS1P31327 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CPS1P31327 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CPS1P31327 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
CPS1P31327 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CPS1P31327 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
CPS1P31327 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CPS1P31327 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
CPS1P31327 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CPS1P31327 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CPS1P31327 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CPS1P31327 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CPS1P31327 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CPS1P31327 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CPS1P31327 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CPS1P31327 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CPS1P31327 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CPS1P31327 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
CPS1P31327 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
CPS1P31327 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CPS1P31327 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CPS1P31327 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CPS1P31327 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CPS1P31327 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CPS1P31327 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CPS1P31327 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CPS1P31327 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CPS1P31327 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CPS1P31327 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CPS1P31327 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CPS1P31327 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CPS1P31327 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CPS1P31327 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CPS1P31327 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CPS1P31327 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CPS1P31327 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CPS1P31327 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CPS1P31327 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CPS1P31327 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
CPS1P31327 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
CPS1P31327 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CPS1P31327 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CPS1P31327 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CPS1P31327 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CPS1P31327 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CPS1P31327 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
CPS1P31327 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CPS1P31327 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CPS1P31327 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CPS1P31327 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CPS1P31327 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CPS1P31327 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CPS1P31327 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CPS1P31327 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CPS1P31327 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CPS1P31327 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms