Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRDX6P30041 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PRDX6P30041 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRDX6P30041 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRDX6P30041 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRDX6P30041 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDX6P30041 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PRDX6P30041 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PRDX6P30041 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PRDX6P30041 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PRDX6P30041 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PRDX6P30041 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRDX6P30041 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDX6P30041 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDX6P30041 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDX6P30041 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDX6P30041 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDX6P30041 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDX6P30041 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDX6P30041 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDX6P30041 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PRDX6P30041 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRDX6P30041 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRDX6P30041 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDX6P30041 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDX6P30041 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRDX6P30041 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDX6P30041 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDX6P30041 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDX6P30041 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDX6P30041 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRDX6P30041 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDX6P30041 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDX6P30041 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDX6P30041 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDX6P30041 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDX6P30041 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDX6P30041 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDX6P30041 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDX6P30041 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDX6P30041 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDX6P30041 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDX6P30041 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDX6P30041 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRDX6P30041 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDX6P30041 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDX6P30041 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDX6P30041 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDX6P30041 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDX6P30041 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDX6P30041 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDX6P30041 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDX6P30041 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDX6P30041 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDX6P30041 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDX6P30041 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDX6P30041 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRDX6P30041 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDX6P30041 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDX6P30041 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDX6P30041 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDX6P30041 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDX6P30041 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDX6P30041 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDX6P30041 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDX6P30041 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDX6P30041 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDX6P30041 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDX6P30041 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDX6P30041 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDX6P30041 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDX6P30041 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDX6P30041 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDX6P30041 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDX6P30041 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDX6P30041 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDX6P30041 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDX6P30041 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDX6P30041 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDX6P30041 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDX6P30041 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDX6P30041 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDX6P30041 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDX6P30041 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDX6P30041 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDX6P30041 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDX6P30041 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDX6P30041 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDX6P30041 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDX6P30041 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDX6P30041 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDX6P30041 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDX6P30041 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDX6P30041 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDX6P30041 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDX6P30041 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDX6P30041 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDX6P30041 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDX6P30041 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDX6P30041 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms