Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMB6P28072 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMB6P28072 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMB6P28072 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMB6P28072 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMB6P28072 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMB6P28072 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMB6P28072 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMB6P28072 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMB6P28072 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMB6P28072 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMB6P28072 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMB6P28072 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMB6P28072 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMB6P28072 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMB6P28072 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB6P28072 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMB6P28072 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMB6P28072 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMB6P28072 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMB6P28072 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB6P28072 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB6P28072 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB6P28072 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB6P28072 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMB6P28072 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMB6P28072 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB6P28072 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMB6P28072 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB6P28072 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMB6P28072 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMB6P28072 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMB6P28072 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMB6P28072 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB6P28072 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB6P28072 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB6P28072 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB6P28072 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMB6P28072 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMB6P28072 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB6P28072 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB6P28072 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB6P28072 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB6P28072 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB6P28072 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB6P28072 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB6P28072 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB6P28072 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB6P28072 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMB6P28072 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB6P28072 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB6P28072 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB6P28072 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB6P28072 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB6P28072 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB6P28072 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB6P28072 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB6P28072 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMB6P28072 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB6P28072 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB6P28072 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB6P28072 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB6P28072 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB6P28072 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB6P28072 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB6P28072 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMB6P28072 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB6P28072 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB6P28072 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB6P28072 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB6P28072 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMB6P28072 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB6P28072 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMB6P28072 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB6P28072 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMB6P28072 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB6P28072 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB6P28072 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB6P28072 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB6P28072 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB6P28072 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB6P28072 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB6P28072 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB6P28072 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB6P28072 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB6P28072 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB6P28072 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB6P28072 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB6P28072 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB6P28072 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB6P28072 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB6P28072 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMB6P28072 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB6P28072 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB6P28072 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB6P28072 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB6P28072 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB6P28072 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB6P28072 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB6P28072 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms