Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83not detected
U2AF2P26368 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81not detected
U2AF2P26368 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7not detected
U2AF2P26368 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.683e-11■■□□□ 12.7
U2AF2P26368 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66not detected
U2AF2P26368 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63not detected
U2AF2P26368 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63not detected
U2AF2P26368 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61not detected
U2AF2P26368 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6not detected
U2AF2P26368 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54not detected
U2AF2P26368 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.532e-7■□□□□ 9.5
U2AF2P26368 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52not detected
U2AF2P26368 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5not detected
U2AF2P26368 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45not detected
U2AF2P26368 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42not detected
U2AF2P26368 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.384e-6■■□□□ 13.2
U2AF2P26368 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37not detected
U2AF2P26368 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37not detected
U2AF2P26368 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.374e-9■□□□□ 11.2
U2AF2P26368 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35not detected
U2AF2P26368 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35not detected
U2AF2P26368 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34not detected
U2AF2P26368 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33not detected
U2AF2P26368 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32not detected
U2AF2P26368 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31not detected
U2AF2P26368 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31not detected
U2AF2P26368 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29not detected
U2AF2P26368 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28not detected
U2AF2P26368 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28not detected
U2AF2P26368 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.274e-8■□□□□ 10
U2AF2P26368 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26not detected
U2AF2P26368 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.251e-9■■■□□ 18.1
U2AF2P26368 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.251e-13■■■■□ 24.8
U2AF2P26368 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23not detected
U2AF2P26368 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23not detected
U2AF2P26368 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.224e-8■□□□□ 10
U2AF2P26368 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21not detected
U2AF2P26368 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.212e-6■□□□□ 10.6
U2AF2P26368 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2not detected
U2AF2P26368 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17not detected
U2AF2P26368 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.171e-8■■□□□ 12.5
U2AF2P26368 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17not detected
U2AF2P26368 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16not detected
U2AF2P26368 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.147e-17■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13not detected
U2AF2P26368 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12not detected
U2AF2P26368 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11not detected
U2AF2P26368 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11not detected
U2AF2P26368 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.114e-24■■□□□ 13.9
U2AF2P26368 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1not detected
U2AF2P26368 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1not detected
U2AF2P26368 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1not detected
U2AF2P26368 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1not detected
U2AF2P26368 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1not detected
U2AF2P26368 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09not detected
U2AF2P26368 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.094e-7■■■■□ 26.5
U2AF2P26368 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09not detected
U2AF2P26368 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08not detected
U2AF2P26368 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06not detected
U2AF2P26368 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06not detected
U2AF2P26368 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06not detected
U2AF2P26368 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05not detected
U2AF2P26368 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05not detected
U2AF2P26368 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05not detected
U2AF2P26368 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05not detected
U2AF2P26368 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03not detected
U2AF2P26368 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03not detected
U2AF2P26368 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03not detected
U2AF2P26368 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02not detected
U2AF2P26368 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02not detected
U2AF2P26368 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.016e-8■□□□□ 9.9
U2AF2P26368 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01not detected
U2AF2P26368 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01not detected
U2AF2P26368 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3not detected
U2AF2P26368 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 35e-16■□□□□ 10
U2AF2P26368 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 32e-8■■□□□ 14.4
U2AF2P26368 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99not detected
U2AF2P26368 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99not detected
U2AF2P26368 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98not detected
U2AF2P26368 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98not detected
U2AF2P26368 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.987e-8■■■■□ 22.4
U2AF2P26368 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98not detected
U2AF2P26368 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97not detected
U2AF2P26368 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96not detected
U2AF2P26368 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96not detected
U2AF2P26368 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96not detected
U2AF2P26368 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.962e-6■□□□□ 10.7
U2AF2P26368 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96not detected
U2AF2P26368 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95not detected
U2AF2P26368 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95not detected
U2AF2P26368 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93not detected
U2AF2P26368 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93not detected
U2AF2P26368 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92not detected
U2AF2P26368 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92not detected
U2AF2P26368 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92not detected
U2AF2P26368 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.922e-6■□□□□ 9.9
U2AF2P26368 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92not detected
U2AF2P26368 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91not detected
U2AF2P26368 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91not detected
U2AF2P26368 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.98e-6■■■■□ 25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms