Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLC6A2P23975 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLC6A2P23975 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLC6A2P23975 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC6A2P23975 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLC6A2P23975 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SLC6A2P23975 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLC6A2P23975 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLC6A2P23975 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLC6A2P23975 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLC6A2P23975 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC6A2P23975 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC6A2P23975 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC6A2P23975 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC6A2P23975 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC6A2P23975 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC6A2P23975 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC6A2P23975 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC6A2P23975 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC6A2P23975 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC6A2P23975 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC6A2P23975 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC6A2P23975 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC6A2P23975 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC6A2P23975 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC6A2P23975 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC6A2P23975 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC6A2P23975 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC6A2P23975 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC6A2P23975 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC6A2P23975 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC6A2P23975 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC6A2P23975 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC6A2P23975 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC6A2P23975 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC6A2P23975 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC6A2P23975 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC6A2P23975 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC6A2P23975 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC6A2P23975 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC6A2P23975 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC6A2P23975 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC6A2P23975 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC6A2P23975 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC6A2P23975 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC6A2P23975 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC6A2P23975 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC6A2P23975 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC6A2P23975 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC6A2P23975 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC6A2P23975 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC6A2P23975 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC6A2P23975 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC6A2P23975 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC6A2P23975 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC6A2P23975 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC6A2P23975 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC6A2P23975 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC6A2P23975 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC6A2P23975 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC6A2P23975 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC6A2P23975 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC6A2P23975 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC6A2P23975 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC6A2P23975 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC6A2P23975 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC6A2P23975 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC6A2P23975 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC6A2P23975 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC6A2P23975 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC6A2P23975 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC6A2P23975 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC6A2P23975 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC6A2P23975 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC6A2P23975 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC6A2P23975 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC6A2P23975 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC6A2P23975 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC6A2P23975 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC6A2P23975 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC6A2P23975 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC6A2P23975 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC6A2P23975 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC6A2P23975 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC6A2P23975 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC6A2P23975 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC6A2P23975 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC6A2P23975 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC6A2P23975 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC6A2P23975 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC6A2P23975 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC6A2P23975 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC6A2P23975 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC6A2P23975 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC6A2P23975 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC6A2P23975 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC6A2P23975 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC6A2P23975 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC6A2P23975 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC6A2P23975 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.4 ms