Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC6A2P23975 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC6A2P23975 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC6A2P23975 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC6A2P23975 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC6A2P23975 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC6A2P23975 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC6A2P23975 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC6A2P23975 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC6A2P23975 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC6A2P23975 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC6A2P23975 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC6A2P23975 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A2P23975 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC6A2P23975 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC6A2P23975 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC6A2P23975 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC6A2P23975 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC6A2P23975 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC6A2P23975 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC6A2P23975 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC6A2P23975 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC6A2P23975 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC6A2P23975 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC6A2P23975 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC6A2P23975 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC6A2P23975 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A2P23975 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC6A2P23975 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC6A2P23975 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC6A2P23975 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC6A2P23975 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A2P23975 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC6A2P23975 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC6A2P23975 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC6A2P23975 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC6A2P23975 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC6A2P23975 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC6A2P23975 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC6A2P23975 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC6A2P23975 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC6A2P23975 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC6A2P23975 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC6A2P23975 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC6A2P23975 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC6A2P23975 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC6A2P23975 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC6A2P23975 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC6A2P23975 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A2P23975 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A2P23975 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A2P23975 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC6A2P23975 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC6A2P23975 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC6A2P23975 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC6A2P23975 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms