Protein–RNA interactions for Protein: P16581

SELE, E-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELEP16581 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SELEP16581 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SELEP16581 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SELEP16581 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SELEP16581 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SELEP16581 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SELEP16581 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SELEP16581 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SELEP16581 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SELEP16581 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SELEP16581 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SELEP16581 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SELEP16581 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SELEP16581 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SELEP16581 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SELEP16581 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SELEP16581 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SELEP16581 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SELEP16581 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SELEP16581 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELEP16581 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SELEP16581 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SELEP16581 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SELEP16581 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SELEP16581 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SELEP16581 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SELEP16581 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SELEP16581 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SELEP16581 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SELEP16581 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SELEP16581 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SELEP16581 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SELEP16581 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SELEP16581 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SELEP16581 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SELEP16581 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SELEP16581 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SELEP16581 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SELEP16581 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SELEP16581 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SELEP16581 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SELEP16581 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SELEP16581 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SELEP16581 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELEP16581 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELEP16581 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SELEP16581 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELEP16581 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SELEP16581 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SELEP16581 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SELEP16581 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SELEP16581 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SELEP16581 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELEP16581 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SELEP16581 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SELEP16581 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SELEP16581 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SELEP16581 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SELEP16581 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SELEP16581 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SELEP16581 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SELEP16581 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SELEP16581 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SELEP16581 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SELEP16581 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELEP16581 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELEP16581 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELEP16581 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELEP16581 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELEP16581 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELEP16581 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELEP16581 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELEP16581 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELEP16581 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELEP16581 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELEP16581 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELEP16581 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELEP16581 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SELEP16581 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SELEP16581 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SELEP16581 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SELEP16581 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SELEP16581 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SELEP16581 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SELEP16581 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SELEP16581 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SELEP16581 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SELEP16581 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SELEP16581 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SELEP16581 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SELEP16581 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SELEP16581 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELEP16581 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SELEP16581 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SELEP16581 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SELEP16581 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELEP16581 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SELEP16581 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SELEP16581 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SELEP16581 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms