Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.05■■■■■ 4.48
MYH3P11055 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
MYH3P11055 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
MYH3P11055 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
MYH3P11055 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
MYH3P11055 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
MYH3P11055 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
MYH3P11055 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
MYH3P11055 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
MYH3P11055 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
MYH3P11055 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
MYH3P11055 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
MYH3P11055 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
MYH3P11055 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
MYH3P11055 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
MYH3P11055 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
MYH3P11055 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
MYH3P11055 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
MYH3P11055 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
MYH3P11055 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
MYH3P11055 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
MYH3P11055 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MYH3P11055 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
MYH3P11055 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
MYH3P11055 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
MYH3P11055 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
MYH3P11055 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
MYH3P11055 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MYH3P11055 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
MYH3P11055 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
MYH3P11055 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
MYH3P11055 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
MYH3P11055 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
MYH3P11055 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
MYH3P11055 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
MYH3P11055 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
MYH3P11055 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
MYH3P11055 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
MYH3P11055 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
MYH3P11055 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
MYH3P11055 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
MYH3P11055 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
MYH3P11055 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
MYH3P11055 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
MYH3P11055 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
MYH3P11055 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MYH3P11055 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
MYH3P11055 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MYH3P11055 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MYH3P11055 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
MYH3P11055 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MYH3P11055 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MYH3P11055 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
MYH3P11055 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MYH3P11055 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MYH3P11055 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYH3P11055 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYH3P11055 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYH3P11055 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
MYH3P11055 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MYH3P11055 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
MYH3P11055 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MYH3P11055 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MYH3P11055 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYH3P11055 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MYH3P11055 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
MYH3P11055 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYH3P11055 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYH3P11055 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MYH3P11055 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
MYH3P11055 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MYH3P11055 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MYH3P11055 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MYH3P11055 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
MYH3P11055 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MYH3P11055 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
MYH3P11055 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MYH3P11055 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
MYH3P11055 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MYH3P11055 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MYH3P11055 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
MYH3P11055 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MYH3P11055 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MYH3P11055 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MYH3P11055 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MYH3P11055 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
MYH3P11055 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
MYH3P11055 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MYH3P11055 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
MYH3P11055 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
MYH3P11055 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
MYH3P11055 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
MYH3P11055 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MYH3P11055 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
MYH3P11055 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MYH3P11055 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
MYH3P11055 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
MYH3P11055 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
MYH3P11055 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MYH3P11055 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms