Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKHD1P08F94 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKHD1P08F94 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKHD1P08F94 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKHD1P08F94 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKHD1P08F94 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKHD1P08F94 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKHD1P08F94 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKHD1P08F94 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKHD1P08F94 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKHD1P08F94 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKHD1P08F94 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKHD1P08F94 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKHD1P08F94 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKHD1P08F94 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKHD1P08F94 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKHD1P08F94 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKHD1P08F94 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKHD1P08F94 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKHD1P08F94 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKHD1P08F94 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PKHD1P08F94 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKHD1P08F94 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKHD1P08F94 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKHD1P08F94 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKHD1P08F94 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKHD1P08F94 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKHD1P08F94 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKHD1P08F94 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PKHD1P08F94 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKHD1P08F94 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKHD1P08F94 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKHD1P08F94 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKHD1P08F94 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PKHD1P08F94 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKHD1P08F94 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PKHD1P08F94 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKHD1P08F94 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKHD1P08F94 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKHD1P08F94 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKHD1P08F94 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKHD1P08F94 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKHD1P08F94 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKHD1P08F94 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKHD1P08F94 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKHD1P08F94 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKHD1P08F94 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKHD1P08F94 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKHD1P08F94 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKHD1P08F94 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKHD1P08F94 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKHD1P08F94 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKHD1P08F94 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKHD1P08F94 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKHD1P08F94 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKHD1P08F94 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKHD1P08F94 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PKHD1P08F94 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKHD1P08F94 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKHD1P08F94 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKHD1P08F94 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKHD1P08F94 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKHD1P08F94 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKHD1P08F94 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKHD1P08F94 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKHD1P08F94 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKHD1P08F94 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKHD1P08F94 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKHD1P08F94 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKHD1P08F94 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKHD1P08F94 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKHD1P08F94 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PKHD1P08F94 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PKHD1P08F94 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PKHD1P08F94 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PKHD1P08F94 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKHD1P08F94 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKHD1P08F94 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PKHD1P08F94 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PKHD1P08F94 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKHD1P08F94 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PKHD1P08F94 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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