Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
GJB1P08034 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
GJB1P08034 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
GJB1P08034 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GJB1P08034 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GJB1P08034 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
GJB1P08034 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
GJB1P08034 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
GJB1P08034 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GJB1P08034 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
GJB1P08034 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GJB1P08034 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GJB1P08034 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GJB1P08034 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GJB1P08034 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GJB1P08034 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37■■■■□ 3.51
GJB1P08034 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GJB1P08034 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GJB1P08034 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GJB1P08034 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GJB1P08034 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GJB1P08034 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GJB1P08034 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GJB1P08034 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GJB1P08034 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GJB1P08034 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GJB1P08034 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GJB1P08034 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
GJB1P08034 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GJB1P08034 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
GJB1P08034 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GJB1P08034 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GJB1P08034 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GJB1P08034 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GJB1P08034 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GJB1P08034 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GJB1P08034 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
GJB1P08034 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
GJB1P08034 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GJB1P08034 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
GJB1P08034 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GJB1P08034 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GJB1P08034 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJB1P08034 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GJB1P08034 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GJB1P08034 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GJB1P08034 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GJB1P08034 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GJB1P08034 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GJB1P08034 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GJB1P08034 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GJB1P08034 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GJB1P08034 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GJB1P08034 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GJB1P08034 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GJB1P08034 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GJB1P08034 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GJB1P08034 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GJB1P08034 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GJB1P08034 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GJB1P08034 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GJB1P08034 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GJB1P08034 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GJB1P08034 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GJB1P08034 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GJB1P08034 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GJB1P08034 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GJB1P08034 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GJB1P08034 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GJB1P08034 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GJB1P08034 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJB1P08034 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJB1P08034 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GJB1P08034 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJB1P08034 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GJB1P08034 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GJB1P08034 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GJB1P08034 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GJB1P08034 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GJB1P08034 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GJB1P08034 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GJB1P08034 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GJB1P08034 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GJB1P08034 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GJB1P08034 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GJB1P08034 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GJB1P08034 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GJB1P08034 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GJB1P08034 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GJB1P08034 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GJB1P08034 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GJB1P08034 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GJB1P08034 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GJB1P08034 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GJB1P08034 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GJB1P08034 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GJB1P08034 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GJB1P08034 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GJB1P08034 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GJB1P08034 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms