Protein–RNA interactions for Protein: P01619

IGKV3-20, Immunoglobulin kappa variable 3-20, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-20P01619 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IGKV3-20P01619 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGKV3-20P01619 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGKV3-20P01619 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IGKV3-20P01619 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV3-20P01619 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV3-20P01619 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV3-20P01619 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV3-20P01619 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV3-20P01619 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV3-20P01619 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV3-20P01619 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGKV3-20P01619 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGKV3-20P01619 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGKV3-20P01619 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV3-20P01619 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV3-20P01619 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV3-20P01619 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGKV3-20P01619 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGKV3-20P01619 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGKV3-20P01619 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGKV3-20P01619 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGKV3-20P01619 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGKV3-20P01619 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IGKV3-20P01619 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGKV3-20P01619 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGKV3-20P01619 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV3-20P01619 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV3-20P01619 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGKV3-20P01619 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV3-20P01619 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV3-20P01619 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV3-20P01619 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGKV3-20P01619 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-20P01619 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-20P01619 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV3-20P01619 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV3-20P01619 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-20P01619 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV3-20P01619 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV3-20P01619 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV3-20P01619 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-20P01619 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-20P01619 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-20P01619 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-20P01619 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-20P01619 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-20P01619 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV3-20P01619 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-20P01619 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV3-20P01619 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-20P01619 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV3-20P01619 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV3-20P01619 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV3-20P01619 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV3-20P01619 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV3-20P01619 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV3-20P01619 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV3-20P01619 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV3-20P01619 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV3-20P01619 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-20P01619 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-20P01619 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-20P01619 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV3-20P01619 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV3-20P01619 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV3-20P01619 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV3-20P01619 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-20P01619 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV3-20P01619 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV3-20P01619 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV3-20P01619 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-20P01619 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV3-20P01619 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV3-20P01619 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGKV3-20P01619 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV3-20P01619 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV3-20P01619 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV3-20P01619 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV3-20P01619 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-20P01619 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV3-20P01619 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGKV3-20P01619 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV3-20P01619 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV3-20P01619 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV3-20P01619 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV3-20P01619 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV3-20P01619 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV3-20P01619 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGKV3-20P01619 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV3-20P01619 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV3-20P01619 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV3-20P01619 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV3-20P01619 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV3-20P01619 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV3-20P01619 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV3-20P01619 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV3-20P01619 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGKV3-20P01619 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV3-20P01619 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms