Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CLSTN1O94985 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLSTN1O94985 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSTN1O94985 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CLSTN1O94985 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CLSTN1O94985 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLSTN1O94985 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLSTN1O94985 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLSTN1O94985 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLSTN1O94985 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSTN1O94985 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSTN1O94985 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLSTN1O94985 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLSTN1O94985 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLSTN1O94985 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLSTN1O94985 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLSTN1O94985 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSTN1O94985 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSTN1O94985 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLSTN1O94985 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLSTN1O94985 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLSTN1O94985 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLSTN1O94985 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLSTN1O94985 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CLSTN1O94985 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLSTN1O94985 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLSTN1O94985 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLSTN1O94985 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLSTN1O94985 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLSTN1O94985 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLSTN1O94985 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLSTN1O94985 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLSTN1O94985 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CLSTN1O94985 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLSTN1O94985 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSTN1O94985 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLSTN1O94985 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLSTN1O94985 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSTN1O94985 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLSTN1O94985 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLSTN1O94985 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLSTN1O94985 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLSTN1O94985 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLSTN1O94985 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLSTN1O94985 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLSTN1O94985 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLSTN1O94985 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLSTN1O94985 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLSTN1O94985 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLSTN1O94985 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLSTN1O94985 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLSTN1O94985 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLSTN1O94985 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLSTN1O94985 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLSTN1O94985 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSTN1O94985 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSTN1O94985 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSTN1O94985 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLSTN1O94985 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLSTN1O94985 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLSTN1O94985 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLSTN1O94985 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSTN1O94985 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSTN1O94985 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLSTN1O94985 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLSTN1O94985 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLSTN1O94985 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLSTN1O94985 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLSTN1O94985 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CLSTN1O94985 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLSTN1O94985 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLSTN1O94985 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLSTN1O94985 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLSTN1O94985 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLSTN1O94985 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CLSTN1O94985 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLSTN1O94985 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLSTN1O94985 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLSTN1O94985 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CLSTN1O94985 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CLSTN1O94985 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLSTN1O94985 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLSTN1O94985 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CLSTN1O94985 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CLSTN1O94985 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CLSTN1O94985 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CLSTN1O94985 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLSTN1O94985 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLSTN1O94985 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLSTN1O94985 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLSTN1O94985 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CLSTN1O94985 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLSTN1O94985 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLSTN1O94985 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLSTN1O94985 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLSTN1O94985 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLSTN1O94985 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CLSTN1O94985 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLSTN1O94985 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLSTN1O94985 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms