Protein–RNA interactions for Protein: O94911

ABCA8, ATP-binding cassette sub-family A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA8O94911 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.17■■■■■ 6.42
ABCA8O94911 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.94■■■■■ 6.39
ABCA8O94911 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.2■■■■■ 6.27
ABCA8O94911 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.92■■■■■ 6.22
ABCA8O94911 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
ABCA8O94911 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.94■■■■■ 6.07
ABCA8O94911 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
ABCA8O94911 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.48■■■■■ 5.99
ABCA8O94911 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.47■■■■■ 5.99
ABCA8O94911 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC52.34■■■■■ 5.97
ABCA8O94911 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
ABCA8O94911 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.18■■■■■ 5.94
ABCA8O94911 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.15■■■■■ 5.94
ABCA8O94911 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
ABCA8O94911 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
ABCA8O94911 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCA8O94911 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.47■■■■■ 5.83
ABCA8O94911 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
ABCA8O94911 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
ABCA8O94911 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
ABCA8O94911 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
ABCA8O94911 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
ABCA8O94911 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
ABCA8O94911 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.64■■■■■ 5.7
ABCA8O94911 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.63■■■■■ 5.7
ABCA8O94911 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
ABCA8O94911 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
ABCA8O94911 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC50.38■■■■■ 5.66
ABCA8O94911 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.35■■■■■ 5.65
ABCA8O94911 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
ABCA8O94911 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.11■■■■■ 5.61
ABCA8O94911 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC50.07■■■■■ 5.61
ABCA8O94911 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC50.06■■■■■ 5.6
ABCA8O94911 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC50.04■■■■■ 5.6
ABCA8O94911 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
ABCA8O94911 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC49.64■■■■■ 5.54
ABCA8O94911 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.62■■■■■ 5.53
ABCA8O94911 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
ABCA8O94911 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
ABCA8O94911 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
ABCA8O94911 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
ABCA8O94911 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
ABCA8O94911 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
ABCA8O94911 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
ABCA8O94911 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
ABCA8O94911 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
ABCA8O94911 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.59■■■■■ 5.37
ABCA8O94911 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
ABCA8O94911 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.56■■■■■ 5.36
ABCA8O94911 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC48.43■■■■■ 5.34
ABCA8O94911 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.43■■■■■ 5.34
ABCA8O94911 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
ABCA8O94911 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
ABCA8O94911 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
ABCA8O94911 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
ABCA8O94911 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
ABCA8O94911 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
ABCA8O94911 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC48.23■■■■■ 5.31
ABCA8O94911 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
ABCA8O94911 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48.22■■■■■ 5.31
ABCA8O94911 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC48.2■■■■■ 5.31
ABCA8O94911 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
ABCA8O94911 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
ABCA8O94911 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCA8O94911 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCA8O94911 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.86■■■■■ 5.25
ABCA8O94911 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
ABCA8O94911 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
ABCA8O94911 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
ABCA8O94911 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
ABCA8O94911 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCA8O94911 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCA8O94911 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCA8O94911 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
ABCA8O94911 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.6■■■■■ 5.21
ABCA8O94911 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
ABCA8O94911 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
ABCA8O94911 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
ABCA8O94911 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
ABCA8O94911 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
ABCA8O94911 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
ABCA8O94911 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ABCA8O94911 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC47.52■■■■■ 5.2
ABCA8O94911 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ABCA8O94911 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCA8O94911 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
ABCA8O94911 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.39■■■■■ 5.18
ABCA8O94911 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
ABCA8O94911 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
ABCA8O94911 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC47.16■■■■■ 5.14
ABCA8O94911 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.16■■■■■ 5.14
ABCA8O94911 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
ABCA8O94911 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.13
ABCA8O94911 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
ABCA8O94911 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
ABCA8O94911 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
ABCA8O94911 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.04■■■■■ 5.12
ABCA8O94911 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ABCA8O94911 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
ABCA8O94911 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms