Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.71■■■■■ 5.07
LTN1O94822 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
LTN1O94822 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
LTN1O94822 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
LTN1O94822 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
LTN1O94822 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
LTN1O94822 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
LTN1O94822 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
LTN1O94822 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
LTN1O94822 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
LTN1O94822 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
LTN1O94822 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
LTN1O94822 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
LTN1O94822 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
LTN1O94822 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
LTN1O94822 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
LTN1O94822 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
LTN1O94822 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
LTN1O94822 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
LTN1O94822 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LTN1O94822 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
LTN1O94822 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
LTN1O94822 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
LTN1O94822 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
LTN1O94822 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
LTN1O94822 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
LTN1O94822 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
LTN1O94822 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
LTN1O94822 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
LTN1O94822 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
LTN1O94822 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
LTN1O94822 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
LTN1O94822 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
LTN1O94822 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
LTN1O94822 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
LTN1O94822 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
LTN1O94822 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
LTN1O94822 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
LTN1O94822 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
LTN1O94822 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
LTN1O94822 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
LTN1O94822 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
LTN1O94822 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
LTN1O94822 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
LTN1O94822 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
LTN1O94822 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
LTN1O94822 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
LTN1O94822 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
LTN1O94822 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
LTN1O94822 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41■■■■■ 4.15
LTN1O94822 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
LTN1O94822 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
LTN1O94822 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
LTN1O94822 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
LTN1O94822 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
LTN1O94822 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
LTN1O94822 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
LTN1O94822 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
LTN1O94822 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
LTN1O94822 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
LTN1O94822 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
LTN1O94822 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
LTN1O94822 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
LTN1O94822 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LTN1O94822 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
LTN1O94822 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
LTN1O94822 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
LTN1O94822 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
LTN1O94822 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
LTN1O94822 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
LTN1O94822 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
LTN1O94822 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
LTN1O94822 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
LTN1O94822 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
LTN1O94822 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
LTN1O94822 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
LTN1O94822 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
LTN1O94822 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
LTN1O94822 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
LTN1O94822 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
LTN1O94822 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
LTN1O94822 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
LTN1O94822 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
LTN1O94822 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
LTN1O94822 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
LTN1O94822 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
LTN1O94822 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
LTN1O94822 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
LTN1O94822 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
LTN1O94822 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
LTN1O94822 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
LTN1O94822 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
LTN1O94822 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
LTN1O94822 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
LTN1O94822 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
LTN1O94822 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
LTN1O94822 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
LTN1O94822 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
LTN1O94822 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
LTN1O94822 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms