Protein–RNA interactions for Protein: O75747

PIK3C2G, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2GO75747 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.51■■■■■ 5.52
PIK3C2GO75747 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.65■■■■■ 5.38
PIK3C2GO75747 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
PIK3C2GO75747 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
PIK3C2GO75747 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
PIK3C2GO75747 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
PIK3C2GO75747 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.75■■■■■ 5.23
PIK3C2GO75747 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.5■■■■■ 5.19
PIK3C2GO75747 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
PIK3C2GO75747 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
PIK3C2GO75747 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.37■■■■■ 5.01
PIK3C2GO75747 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
PIK3C2GO75747 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
PIK3C2GO75747 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
PIK3C2GO75747 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
PIK3C2GO75747 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
PIK3C2GO75747 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
PIK3C2GO75747 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
PIK3C2GO75747 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
PIK3C2GO75747 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
PIK3C2GO75747 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
PIK3C2GO75747 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
PIK3C2GO75747 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
PIK3C2GO75747 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
PIK3C2GO75747 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
PIK3C2GO75747 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
PIK3C2GO75747 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
PIK3C2GO75747 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
PIK3C2GO75747 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
PIK3C2GO75747 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
PIK3C2GO75747 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
PIK3C2GO75747 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
PIK3C2GO75747 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
PIK3C2GO75747 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
PIK3C2GO75747 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
PIK3C2GO75747 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
PIK3C2GO75747 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
PIK3C2GO75747 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
PIK3C2GO75747 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
PIK3C2GO75747 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
PIK3C2GO75747 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
PIK3C2GO75747 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PIK3C2GO75747 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
PIK3C2GO75747 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
PIK3C2GO75747 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
PIK3C2GO75747 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
PIK3C2GO75747 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
PIK3C2GO75747 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PIK3C2GO75747 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
PIK3C2GO75747 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PIK3C2GO75747 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
PIK3C2GO75747 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
PIK3C2GO75747 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
PIK3C2GO75747 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PIK3C2GO75747 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
PIK3C2GO75747 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
PIK3C2GO75747 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PIK3C2GO75747 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PIK3C2GO75747 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PIK3C2GO75747 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PIK3C2GO75747 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PIK3C2GO75747 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
PIK3C2GO75747 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PIK3C2GO75747 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PIK3C2GO75747 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PIK3C2GO75747 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
PIK3C2GO75747 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PIK3C2GO75747 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PIK3C2GO75747 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PIK3C2GO75747 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PIK3C2GO75747 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PIK3C2GO75747 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
PIK3C2GO75747 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
PIK3C2GO75747 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PIK3C2GO75747 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PIK3C2GO75747 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PIK3C2GO75747 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PIK3C2GO75747 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PIK3C2GO75747 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PIK3C2GO75747 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
PIK3C2GO75747 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PIK3C2GO75747 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PIK3C2GO75747 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PIK3C2GO75747 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
PIK3C2GO75747 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PIK3C2GO75747 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
PIK3C2GO75747 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
PIK3C2GO75747 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PIK3C2GO75747 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
PIK3C2GO75747 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
PIK3C2GO75747 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
PIK3C2GO75747 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
PIK3C2GO75747 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
PIK3C2GO75747 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PIK3C2GO75747 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PIK3C2GO75747 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
PIK3C2GO75747 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
PIK3C2GO75747 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
PIK3C2GO75747 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
PIK3C2GO75747 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms