Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
STX11O75558 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
STX11O75558 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
STX11O75558 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
STX11O75558 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
STX11O75558 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STX11O75558 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
STX11O75558 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STX11O75558 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
STX11O75558 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
STX11O75558 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STX11O75558 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STX11O75558 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STX11O75558 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STX11O75558 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STX11O75558 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
STX11O75558 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX11O75558 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STX11O75558 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STX11O75558 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
STX11O75558 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STX11O75558 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STX11O75558 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STX11O75558 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STX11O75558 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STX11O75558 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STX11O75558 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STX11O75558 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STX11O75558 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STX11O75558 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STX11O75558 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX11O75558 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STX11O75558 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STX11O75558 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STX11O75558 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STX11O75558 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STX11O75558 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STX11O75558 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STX11O75558 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STX11O75558 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX11O75558 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX11O75558 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STX11O75558 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STX11O75558 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STX11O75558 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STX11O75558 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STX11O75558 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STX11O75558 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STX11O75558 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STX11O75558 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STX11O75558 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STX11O75558 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STX11O75558 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STX11O75558 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX11O75558 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STX11O75558 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX11O75558 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX11O75558 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX11O75558 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX11O75558 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STX11O75558 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX11O75558 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX11O75558 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STX11O75558 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STX11O75558 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STX11O75558 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STX11O75558 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STX11O75558 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STX11O75558 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STX11O75558 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STX11O75558 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STX11O75558 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
STX11O75558 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX11O75558 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX11O75558 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX11O75558 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX11O75558 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX11O75558 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX11O75558 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX11O75558 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX11O75558 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX11O75558 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STX11O75558 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STX11O75558 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX11O75558 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STX11O75558 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
STX11O75558 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STX11O75558 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX11O75558 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX11O75558 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX11O75558 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX11O75558 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX11O75558 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX11O75558 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX11O75558 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STX11O75558 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX11O75558 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX11O75558 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX11O75558 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STX11O75558 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms