Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LPXNO60711 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LPXNO60711 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LPXNO60711 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LPXNO60711 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
LPXNO60711 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LPXNO60711 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
LPXNO60711 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LPXNO60711 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LPXNO60711 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LPXNO60711 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LPXNO60711 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
LPXNO60711 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LPXNO60711 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LPXNO60711 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LPXNO60711 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LPXNO60711 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
LPXNO60711 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LPXNO60711 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LPXNO60711 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LPXNO60711 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LPXNO60711 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LPXNO60711 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LPXNO60711 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LPXNO60711 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LPXNO60711 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LPXNO60711 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LPXNO60711 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
LPXNO60711 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LPXNO60711 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LPXNO60711 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LPXNO60711 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
LPXNO60711 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LPXNO60711 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LPXNO60711 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LPXNO60711 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
LPXNO60711 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LPXNO60711 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LPXNO60711 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LPXNO60711 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LPXNO60711 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LPXNO60711 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LPXNO60711 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LPXNO60711 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LPXNO60711 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LPXNO60711 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LPXNO60711 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LPXNO60711 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LPXNO60711 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LPXNO60711 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LPXNO60711 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LPXNO60711 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LPXNO60711 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LPXNO60711 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LPXNO60711 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LPXNO60711 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LPXNO60711 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LPXNO60711 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LPXNO60711 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LPXNO60711 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LPXNO60711 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LPXNO60711 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LPXNO60711 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LPXNO60711 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LPXNO60711 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LPXNO60711 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LPXNO60711 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LPXNO60711 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LPXNO60711 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LPXNO60711 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LPXNO60711 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LPXNO60711 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LPXNO60711 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LPXNO60711 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
LPXNO60711 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LPXNO60711 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LPXNO60711 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LPXNO60711 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LPXNO60711 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
LPXNO60711 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LPXNO60711 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LPXNO60711 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LPXNO60711 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LPXNO60711 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LPXNO60711 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LPXNO60711 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LPXNO60711 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LPXNO60711 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LPXNO60711 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LPXNO60711 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LPXNO60711 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LPXNO60711 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
LPXNO60711 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LPXNO60711 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LPXNO60711 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LPXNO60711 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LPXNO60711 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LPXNO60711 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LPXNO60711 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LPXNO60711 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms