Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TSPAN2O60636 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TSPAN2O60636 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TSPAN2O60636 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TSPAN2O60636 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TSPAN2O60636 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TSPAN2O60636 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSPAN2O60636 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TSPAN2O60636 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSPAN2O60636 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSPAN2O60636 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSPAN2O60636 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSPAN2O60636 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSPAN2O60636 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSPAN2O60636 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TSPAN2O60636 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSPAN2O60636 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSPAN2O60636 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSPAN2O60636 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSPAN2O60636 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TSPAN2O60636 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TSPAN2O60636 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSPAN2O60636 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN2O60636 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TSPAN2O60636 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSPAN2O60636 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSPAN2O60636 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSPAN2O60636 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSPAN2O60636 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSPAN2O60636 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSPAN2O60636 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSPAN2O60636 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSPAN2O60636 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSPAN2O60636 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSPAN2O60636 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN2O60636 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSPAN2O60636 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN2O60636 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN2O60636 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN2O60636 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN2O60636 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN2O60636 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN2O60636 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN2O60636 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN2O60636 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN2O60636 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN2O60636 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN2O60636 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN2O60636 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN2O60636 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSPAN2O60636 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSPAN2O60636 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSPAN2O60636 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN2O60636 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSPAN2O60636 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSPAN2O60636 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN2O60636 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSPAN2O60636 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN2O60636 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN2O60636 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN2O60636 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN2O60636 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN2O60636 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN2O60636 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN2O60636 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSPAN2O60636 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN2O60636 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN2O60636 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN2O60636 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN2O60636 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN2O60636 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN2O60636 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSPAN2O60636 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN2O60636 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN2O60636 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN2O60636 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN2O60636 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN2O60636 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN2O60636 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSPAN2O60636 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN2O60636 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN2O60636 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN2O60636 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN2O60636 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSPAN2O60636 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN2O60636 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSPAN2O60636 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN2O60636 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSPAN2O60636 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN2O60636 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSPAN2O60636 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSPAN2O60636 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms