Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EFNA2O43921 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
EFNA2O43921 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
EFNA2O43921 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EFNA2O43921 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EFNA2O43921 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EFNA2O43921 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFNA2O43921 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EFNA2O43921 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFNA2O43921 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFNA2O43921 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFNA2O43921 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFNA2O43921 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFNA2O43921 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFNA2O43921 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFNA2O43921 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EFNA2O43921 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EFNA2O43921 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EFNA2O43921 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EFNA2O43921 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFNA2O43921 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFNA2O43921 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFNA2O43921 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EFNA2O43921 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EFNA2O43921 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFNA2O43921 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFNA2O43921 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA2O43921 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFNA2O43921 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFNA2O43921 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EFNA2O43921 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EFNA2O43921 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EFNA2O43921 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFNA2O43921 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFNA2O43921 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EFNA2O43921 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EFNA2O43921 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EFNA2O43921 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EFNA2O43921 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EFNA2O43921 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFNA2O43921 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EFNA2O43921 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EFNA2O43921 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFNA2O43921 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFNA2O43921 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFNA2O43921 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFNA2O43921 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFNA2O43921 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFNA2O43921 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFNA2O43921 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EFNA2O43921 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFNA2O43921 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EFNA2O43921 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFNA2O43921 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFNA2O43921 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFNA2O43921 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFNA2O43921 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EFNA2O43921 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EFNA2O43921 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFNA2O43921 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EFNA2O43921 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFNA2O43921 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFNA2O43921 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFNA2O43921 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFNA2O43921 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFNA2O43921 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFNA2O43921 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFNA2O43921 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFNA2O43921 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFNA2O43921 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFNA2O43921 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFNA2O43921 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFNA2O43921 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFNA2O43921 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EFNA2O43921 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EFNA2O43921 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFNA2O43921 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFNA2O43921 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFNA2O43921 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFNA2O43921 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFNA2O43921 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EFNA2O43921 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFNA2O43921 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFNA2O43921 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFNA2O43921 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFNA2O43921 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFNA2O43921 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFNA2O43921 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EFNA2O43921 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFNA2O43921 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFNA2O43921 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFNA2O43921 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFNA2O43921 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFNA2O43921 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFNA2O43921 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFNA2O43921 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EFNA2O43921 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFNA2O43921 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFNA2O43921 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFNA2O43921 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms