Protein–RNA interactions for Protein: O15370

SOX12, Transcription factor SOX-12, humanhuman

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX12O15370 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.04■■■■■ 5.12
SOX12O15370 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
SOX12O15370 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
SOX12O15370 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
SOX12O15370 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
SOX12O15370 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SOX12O15370 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SOX12O15370 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
SOX12O15370 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SOX12O15370 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
SOX12O15370 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
SOX12O15370 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
SOX12O15370 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
SOX12O15370 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SOX12O15370 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
SOX12O15370 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
SOX12O15370 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
SOX12O15370 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SOX12O15370 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SOX12O15370 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SOX12O15370 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SOX12O15370 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SOX12O15370 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SOX12O15370 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SOX12O15370 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SOX12O15370 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SOX12O15370 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
SOX12O15370 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SOX12O15370 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
SOX12O15370 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SOX12O15370 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SOX12O15370 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SOX12O15370 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SOX12O15370 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SOX12O15370 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42■■■■■ 4.31
SOX12O15370 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
SOX12O15370 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
SOX12O15370 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SOX12O15370 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SOX12O15370 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SOX12O15370 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SOX12O15370 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SOX12O15370 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SOX12O15370 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SOX12O15370 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SOX12O15370 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SOX12O15370 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SOX12O15370 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SOX12O15370 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SOX12O15370 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SOX12O15370 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41■■■■■ 4.15
SOX12O15370 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SOX12O15370 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SOX12O15370 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SOX12O15370 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SOX12O15370 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SOX12O15370 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SOX12O15370 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SOX12O15370 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SOX12O15370 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SOX12O15370 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SOX12O15370 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SOX12O15370 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SOX12O15370 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
SOX12O15370 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SOX12O15370 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SOX12O15370 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SOX12O15370 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SOX12O15370 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SOX12O15370 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SOX12O15370 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SOX12O15370 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SOX12O15370 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SOX12O15370 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SOX12O15370 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SOX12O15370 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SOX12O15370 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SOX12O15370 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SOX12O15370 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SOX12O15370 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SOX12O15370 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SOX12O15370 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SOX12O15370 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SOX12O15370 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SOX12O15370 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
SOX12O15370 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SOX12O15370 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SOX12O15370 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SOX12O15370 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SOX12O15370 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SOX12O15370 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SOX12O15370 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SOX12O15370 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
SOX12O15370 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SOX12O15370 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
SOX12O15370 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SOX12O15370 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
SOX12O15370 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SOX12O15370 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SOX12O15370 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
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