Protein–RNA interactions for Protein: O14782

KIF3C, Kinesin-like protein KIF3C, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3CO14782 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
KIF3CO14782 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
KIF3CO14782 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
KIF3CO14782 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
KIF3CO14782 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
KIF3CO14782 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
KIF3CO14782 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
KIF3CO14782 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
KIF3CO14782 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
KIF3CO14782 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
KIF3CO14782 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
KIF3CO14782 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
KIF3CO14782 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
KIF3CO14782 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
KIF3CO14782 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
KIF3CO14782 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
KIF3CO14782 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
KIF3CO14782 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KIF3CO14782 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
KIF3CO14782 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
KIF3CO14782 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KIF3CO14782 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KIF3CO14782 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
KIF3CO14782 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KIF3CO14782 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
KIF3CO14782 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
KIF3CO14782 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
KIF3CO14782 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
KIF3CO14782 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
KIF3CO14782 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KIF3CO14782 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
KIF3CO14782 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
KIF3CO14782 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KIF3CO14782 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
KIF3CO14782 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
KIF3CO14782 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
KIF3CO14782 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
KIF3CO14782 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
KIF3CO14782 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
KIF3CO14782 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KIF3CO14782 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KIF3CO14782 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KIF3CO14782 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KIF3CO14782 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
KIF3CO14782 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
KIF3CO14782 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KIF3CO14782 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIF3CO14782 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIF3CO14782 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KIF3CO14782 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KIF3CO14782 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KIF3CO14782 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIF3CO14782 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KIF3CO14782 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KIF3CO14782 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KIF3CO14782 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
KIF3CO14782 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KIF3CO14782 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KIF3CO14782 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KIF3CO14782 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
KIF3CO14782 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
KIF3CO14782 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KIF3CO14782 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KIF3CO14782 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KIF3CO14782 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
KIF3CO14782 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF3CO14782 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF3CO14782 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
KIF3CO14782 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIF3CO14782 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KIF3CO14782 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIF3CO14782 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KIF3CO14782 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
KIF3CO14782 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KIF3CO14782 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KIF3CO14782 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
KIF3CO14782 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
KIF3CO14782 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
KIF3CO14782 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
KIF3CO14782 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
KIF3CO14782 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
KIF3CO14782 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KIF3CO14782 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
KIF3CO14782 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
KIF3CO14782 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
KIF3CO14782 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIF3CO14782 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KIF3CO14782 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KIF3CO14782 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KIF3CO14782 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KIF3CO14782 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KIF3CO14782 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIF3CO14782 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIF3CO14782 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KIF3CO14782 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
KIF3CO14782 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KIF3CO14782 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KIF3CO14782 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KIF3CO14782 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KIF3CO14782 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms