Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
AP3B1O00203 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
AP3B1O00203 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
AP3B1O00203 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
AP3B1O00203 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
AP3B1O00203 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
AP3B1O00203 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
AP3B1O00203 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
AP3B1O00203 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
AP3B1O00203 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
AP3B1O00203 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
AP3B1O00203 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
AP3B1O00203 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
AP3B1O00203 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
AP3B1O00203 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AP3B1O00203 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
AP3B1O00203 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.69
AP3B1O00203 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AP3B1O00203 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
AP3B1O00203 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
AP3B1O00203 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
AP3B1O00203 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
AP3B1O00203 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
AP3B1O00203 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
AP3B1O00203 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
AP3B1O00203 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
AP3B1O00203 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
AP3B1O00203 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
AP3B1O00203 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
AP3B1O00203 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
AP3B1O00203 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AP3B1O00203 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AP3B1O00203 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AP3B1O00203 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
AP3B1O00203 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
AP3B1O00203 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
AP3B1O00203 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
AP3B1O00203 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
AP3B1O00203 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
AP3B1O00203 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
AP3B1O00203 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AP3B1O00203 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
AP3B1O00203 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
AP3B1O00203 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
AP3B1O00203 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
AP3B1O00203 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
AP3B1O00203 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
AP3B1O00203 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
AP3B1O00203 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
AP3B1O00203 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
AP3B1O00203 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
AP3B1O00203 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AP3B1O00203 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
AP3B1O00203 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AP3B1O00203 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
AP3B1O00203 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AP3B1O00203 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AP3B1O00203 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AP3B1O00203 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
AP3B1O00203 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
AP3B1O00203 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AP3B1O00203 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
AP3B1O00203 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
AP3B1O00203 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AP3B1O00203 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
AP3B1O00203 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
AP3B1O00203 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AP3B1O00203 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AP3B1O00203 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
AP3B1O00203 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AP3B1O00203 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AP3B1O00203 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AP3B1O00203 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AP3B1O00203 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AP3B1O00203 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
AP3B1O00203 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AP3B1O00203 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AP3B1O00203 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
AP3B1O00203 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AP3B1O00203 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AP3B1O00203 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
AP3B1O00203 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AP3B1O00203 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AP3B1O00203 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AP3B1O00203 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AP3B1O00203 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AP3B1O00203 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AP3B1O00203 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AP3B1O00203 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AP3B1O00203 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AP3B1O00203 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
AP3B1O00203 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AP3B1O00203 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AP3B1O00203 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP3B1O00203 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP3B1O00203 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AP3B1O00203 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP3B1O00203 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AP3B1O00203 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AP3B1O00203 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms