Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERVH48-1M5A8F1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ERVH48-1M5A8F1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ERVH48-1M5A8F1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERVH48-1M5A8F1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVH48-1M5A8F1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERVH48-1M5A8F1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVH48-1M5A8F1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVH48-1M5A8F1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVH48-1M5A8F1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVH48-1M5A8F1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVH48-1M5A8F1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERVH48-1M5A8F1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVH48-1M5A8F1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVH48-1M5A8F1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVH48-1M5A8F1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERVH48-1M5A8F1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERVH48-1M5A8F1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERVH48-1M5A8F1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERVH48-1M5A8F1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVH48-1M5A8F1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVH48-1M5A8F1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVH48-1M5A8F1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERVH48-1M5A8F1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVH48-1M5A8F1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVH48-1M5A8F1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVH48-1M5A8F1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVH48-1M5A8F1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVH48-1M5A8F1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVH48-1M5A8F1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVH48-1M5A8F1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVH48-1M5A8F1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVH48-1M5A8F1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVH48-1M5A8F1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVH48-1M5A8F1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVH48-1M5A8F1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERVH48-1M5A8F1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVH48-1M5A8F1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERVH48-1M5A8F1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVH48-1M5A8F1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVH48-1M5A8F1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVH48-1M5A8F1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVH48-1M5A8F1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVH48-1M5A8F1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVH48-1M5A8F1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVH48-1M5A8F1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVH48-1M5A8F1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVH48-1M5A8F1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVH48-1M5A8F1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVH48-1M5A8F1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVH48-1M5A8F1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVH48-1M5A8F1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVH48-1M5A8F1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVH48-1M5A8F1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVH48-1M5A8F1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVH48-1M5A8F1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVH48-1M5A8F1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVH48-1M5A8F1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVH48-1M5A8F1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVH48-1M5A8F1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVH48-1M5A8F1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVH48-1M5A8F1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVH48-1M5A8F1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVH48-1M5A8F1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVH48-1M5A8F1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVH48-1M5A8F1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVH48-1M5A8F1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVH48-1M5A8F1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVH48-1M5A8F1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVH48-1M5A8F1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVH48-1M5A8F1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVH48-1M5A8F1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVH48-1M5A8F1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVH48-1M5A8F1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVH48-1M5A8F1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVH48-1M5A8F1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVH48-1M5A8F1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ERVH48-1M5A8F1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERVH48-1M5A8F1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVH48-1M5A8F1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVH48-1M5A8F1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERVH48-1M5A8F1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERVH48-1M5A8F1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERVH48-1M5A8F1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERVH48-1M5A8F1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERVH48-1M5A8F1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERVH48-1M5A8F1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVH48-1M5A8F1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERVH48-1M5A8F1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVH48-1M5A8F1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms