Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC52.31■■■■■ 5.96
CROCC2H7BZ55 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC51.33■■■■■ 5.81
CROCC2H7BZ55 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
CROCC2H7BZ55 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
CROCC2H7BZ55 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
CROCC2H7BZ55 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.58■■■■■ 5.69
CROCC2H7BZ55 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.54■■■■■ 5.68
CROCC2H7BZ55 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
CROCC2H7BZ55 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
CROCC2H7BZ55 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
CROCC2H7BZ55 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.16■■■■■ 5.46
CROCC2H7BZ55 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
CROCC2H7BZ55 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC49.07■■■■■ 5.45
CROCC2H7BZ55 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.06■■■■■ 5.44
CROCC2H7BZ55 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CROCC2H7BZ55 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
CROCC2H7BZ55 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
CROCC2H7BZ55 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
CROCC2H7BZ55 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
CROCC2H7BZ55 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
CROCC2H7BZ55 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CROCC2H7BZ55 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
CROCC2H7BZ55 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
CROCC2H7BZ55 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
CROCC2H7BZ55 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
CROCC2H7BZ55 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
CROCC2H7BZ55 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
CROCC2H7BZ55 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
CROCC2H7BZ55 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CROCC2H7BZ55 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CROCC2H7BZ55 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
CROCC2H7BZ55 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CROCC2H7BZ55 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
CROCC2H7BZ55 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
CROCC2H7BZ55 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
CROCC2H7BZ55 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
CROCC2H7BZ55 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CROCC2H7BZ55 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.74■■■■■ 5.07
CROCC2H7BZ55 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
CROCC2H7BZ55 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
CROCC2H7BZ55 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
CROCC2H7BZ55 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CROCC2H7BZ55 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
CROCC2H7BZ55 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
CROCC2H7BZ55 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
CROCC2H7BZ55 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
CROCC2H7BZ55 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
CROCC2H7BZ55 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
CROCC2H7BZ55 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
CROCC2H7BZ55 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CROCC2H7BZ55 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CROCC2H7BZ55 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
CROCC2H7BZ55 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
CROCC2H7BZ55 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CROCC2H7BZ55 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
CROCC2H7BZ55 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CROCC2H7BZ55 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
CROCC2H7BZ55 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CROCC2H7BZ55 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CROCC2H7BZ55 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CROCC2H7BZ55 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CROCC2H7BZ55 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CROCC2H7BZ55 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
CROCC2H7BZ55 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CROCC2H7BZ55 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
CROCC2H7BZ55 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CROCC2H7BZ55 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CROCC2H7BZ55 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CROCC2H7BZ55 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CROCC2H7BZ55 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
CROCC2H7BZ55 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
CROCC2H7BZ55 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
CROCC2H7BZ55 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
CROCC2H7BZ55 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CROCC2H7BZ55 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CROCC2H7BZ55 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CROCC2H7BZ55 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
CROCC2H7BZ55 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CROCC2H7BZ55 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CROCC2H7BZ55 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CROCC2H7BZ55 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CROCC2H7BZ55 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CROCC2H7BZ55 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CROCC2H7BZ55 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CROCC2H7BZ55 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CROCC2H7BZ55 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
CROCC2H7BZ55 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
CROCC2H7BZ55 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
CROCC2H7BZ55 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
CROCC2H7BZ55 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CROCC2H7BZ55 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CROCC2H7BZ55 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CROCC2H7BZ55 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CROCC2H7BZ55 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
CROCC2H7BZ55 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CROCC2H7BZ55 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CROCC2H7BZ55 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CROCC2H7BZ55 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CROCC2H7BZ55 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CROCC2H7BZ55 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms