Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ERVV-1B6SEH8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ERVV-1B6SEH8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ERVV-1B6SEH8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ERVV-1B6SEH8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ERVV-1B6SEH8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
ERVV-1B6SEH8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
ERVV-1B6SEH8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
ERVV-1B6SEH8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ERVV-1B6SEH8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ERVV-1B6SEH8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ERVV-1B6SEH8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ERVV-1B6SEH8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ERVV-1B6SEH8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ERVV-1B6SEH8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ERVV-1B6SEH8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
ERVV-1B6SEH8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ERVV-1B6SEH8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ERVV-1B6SEH8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ERVV-1B6SEH8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ERVV-1B6SEH8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ERVV-1B6SEH8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
ERVV-1B6SEH8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ERVV-1B6SEH8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ERVV-1B6SEH8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ERVV-1B6SEH8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ERVV-1B6SEH8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
ERVV-1B6SEH8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
ERVV-1B6SEH8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
ERVV-1B6SEH8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
ERVV-1B6SEH8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ERVV-1B6SEH8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ERVV-1B6SEH8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ERVV-1B6SEH8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
ERVV-1B6SEH8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
ERVV-1B6SEH8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ERVV-1B6SEH8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ERVV-1B6SEH8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ERVV-1B6SEH8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
ERVV-1B6SEH8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ERVV-1B6SEH8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ERVV-1B6SEH8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ERVV-1B6SEH8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ERVV-1B6SEH8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ERVV-1B6SEH8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ERVV-1B6SEH8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ERVV-1B6SEH8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ERVV-1B6SEH8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ERVV-1B6SEH8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ERVV-1B6SEH8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ERVV-1B6SEH8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ERVV-1B6SEH8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
ERVV-1B6SEH8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERVV-1B6SEH8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ERVV-1B6SEH8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERVV-1B6SEH8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ERVV-1B6SEH8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ERVV-1B6SEH8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERVV-1B6SEH8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERVV-1B6SEH8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ERVV-1B6SEH8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ERVV-1B6SEH8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ERVV-1B6SEH8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ERVV-1B6SEH8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ERVV-1B6SEH8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERVV-1B6SEH8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ERVV-1B6SEH8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ERVV-1B6SEH8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERVV-1B6SEH8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ERVV-1B6SEH8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERVV-1B6SEH8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERVV-1B6SEH8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERVV-1B6SEH8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERVV-1B6SEH8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERVV-1B6SEH8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ERVV-1B6SEH8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ERVV-1B6SEH8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ERVV-1B6SEH8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ERVV-1B6SEH8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ERVV-1B6SEH8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ERVV-1B6SEH8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ERVV-1B6SEH8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ERVV-1B6SEH8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ERVV-1B6SEH8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
ERVV-1B6SEH8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ERVV-1B6SEH8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ERVV-1B6SEH8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERVV-1B6SEH8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERVV-1B6SEH8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERVV-1B6SEH8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERVV-1B6SEH8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ERVV-1B6SEH8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ERVV-1B6SEH8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ERVV-1B6SEH8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ERVV-1B6SEH8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ERVV-1B6SEH8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
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