Protein–RNA interactions for Protein: B2RTY4

MYO9A, Unconventional myosin-IXa, humanhuman

Predictions only

Length 2,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9AB2RTY4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYO9AB2RTY4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO9AB2RTY4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO9AB2RTY4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYO9AB2RTY4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYO9AB2RTY4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO9AB2RTY4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO9AB2RTY4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYO9AB2RTY4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYO9AB2RTY4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYO9AB2RTY4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO9AB2RTY4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO9AB2RTY4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYO9AB2RTY4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO9AB2RTY4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO9AB2RTY4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO9AB2RTY4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO9AB2RTY4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO9AB2RTY4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO9AB2RTY4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO9AB2RTY4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYO9AB2RTY4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYO9AB2RTY4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO9AB2RTY4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYO9AB2RTY4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MYO9AB2RTY4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO9AB2RTY4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYO9AB2RTY4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO9AB2RTY4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO9AB2RTY4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYO9AB2RTY4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO9AB2RTY4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO9AB2RTY4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO9AB2RTY4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO9AB2RTY4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO9AB2RTY4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO9AB2RTY4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO9AB2RTY4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO9AB2RTY4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO9AB2RTY4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO9AB2RTY4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYO9AB2RTY4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYO9AB2RTY4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYO9AB2RTY4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYO9AB2RTY4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO9AB2RTY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO9AB2RTY4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO9AB2RTY4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO9AB2RTY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO9AB2RTY4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO9AB2RTY4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO9AB2RTY4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYO9AB2RTY4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYO9AB2RTY4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYO9AB2RTY4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYO9AB2RTY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYO9AB2RTY4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MYO9AB2RTY4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYO9AB2RTY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MYO9AB2RTY4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYO9AB2RTY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO9AB2RTY4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO9AB2RTY4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO9AB2RTY4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO9AB2RTY4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO9AB2RTY4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO9AB2RTY4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO9AB2RTY4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO9AB2RTY4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYO9AB2RTY4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYO9AB2RTY4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYO9AB2RTY4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYO9AB2RTY4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYO9AB2RTY4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO9AB2RTY4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYO9AB2RTY4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYO9AB2RTY4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYO9AB2RTY4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYO9AB2RTY4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYO9AB2RTY4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYO9AB2RTY4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYO9AB2RTY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO9AB2RTY4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MYO9AB2RTY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYO9AB2RTY4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYO9AB2RTY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYO9AB2RTY4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYO9AB2RTY4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYO9AB2RTY4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYO9AB2RTY4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO9AB2RTY4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYO9AB2RTY4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYO9AB2RTY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYO9AB2RTY4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYO9AB2RTY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYO9AB2RTY4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYO9AB2RTY4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MYO9AB2RTY4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MYO9AB2RTY4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYO9AB2RTY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms