Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.13■■■■■ 5.94
FER1L4A9Z1Z3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC51.64■■■■■ 5.86
FER1L4A9Z1Z3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.63■■■■■ 5.86
FER1L4A9Z1Z3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
FER1L4A9Z1Z3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
FER1L4A9Z1Z3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
FER1L4A9Z1Z3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.86■■■■■ 5.57
FER1L4A9Z1Z3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
FER1L4A9Z1Z3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.79■■■■■ 5.56
FER1L4A9Z1Z3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
FER1L4A9Z1Z3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.39■■■■■ 5.5
FER1L4A9Z1Z3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.37■■■■■ 5.49
FER1L4A9Z1Z3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
FER1L4A9Z1Z3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
FER1L4A9Z1Z3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.95■■■■■ 5.43
FER1L4A9Z1Z3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
FER1L4A9Z1Z3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
FER1L4A9Z1Z3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
FER1L4A9Z1Z3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
FER1L4A9Z1Z3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
FER1L4A9Z1Z3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
FER1L4A9Z1Z3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.3■■■■■ 5.32
FER1L4A9Z1Z3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
FER1L4A9Z1Z3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
FER1L4A9Z1Z3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
FER1L4A9Z1Z3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.89■■■■■ 5.26
FER1L4A9Z1Z3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
FER1L4A9Z1Z3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.24
FER1L4A9Z1Z3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.72■■■■■ 5.23
FER1L4A9Z1Z3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
FER1L4A9Z1Z3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
FER1L4A9Z1Z3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.34■■■■■ 5.17
FER1L4A9Z1Z3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
FER1L4A9Z1Z3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
FER1L4A9Z1Z3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.94■■■■■ 5.11
FER1L4A9Z1Z3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.92■■■■■ 5.1
FER1L4A9Z1Z3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
FER1L4A9Z1Z3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
FER1L4A9Z1Z3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
FER1L4A9Z1Z3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
FER1L4A9Z1Z3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
FER1L4A9Z1Z3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
FER1L4A9Z1Z3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
FER1L4A9Z1Z3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
FER1L4A9Z1Z3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
FER1L4A9Z1Z3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
FER1L4A9Z1Z3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
FER1L4A9Z1Z3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
FER1L4A9Z1Z3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
FER1L4A9Z1Z3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.02■■■■■ 4.96
FER1L4A9Z1Z3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
FER1L4A9Z1Z3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
FER1L4A9Z1Z3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
FER1L4A9Z1Z3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.95
FER1L4A9Z1Z3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
FER1L4A9Z1Z3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
FER1L4A9Z1Z3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
FER1L4A9Z1Z3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
FER1L4A9Z1Z3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
FER1L4A9Z1Z3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
FER1L4A9Z1Z3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.72■■■■■ 4.91
FER1L4A9Z1Z3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
FER1L4A9Z1Z3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
FER1L4A9Z1Z3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
FER1L4A9Z1Z3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
FER1L4A9Z1Z3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
FER1L4A9Z1Z3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
FER1L4A9Z1Z3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
FER1L4A9Z1Z3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
FER1L4A9Z1Z3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
FER1L4A9Z1Z3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
FER1L4A9Z1Z3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
FER1L4A9Z1Z3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
FER1L4A9Z1Z3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
FER1L4A9Z1Z3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
FER1L4A9Z1Z3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
FER1L4A9Z1Z3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
FER1L4A9Z1Z3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
FER1L4A9Z1Z3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.8
FER1L4A9Z1Z3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.06■■■■■ 4.8
FER1L4A9Z1Z3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
FER1L4A9Z1Z3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
FER1L4A9Z1Z3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
FER1L4A9Z1Z3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
FER1L4A9Z1Z3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
FER1L4A9Z1Z3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
FER1L4A9Z1Z3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
FER1L4A9Z1Z3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
FER1L4A9Z1Z3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
FER1L4A9Z1Z3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
FER1L4A9Z1Z3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
FER1L4A9Z1Z3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
FER1L4A9Z1Z3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
FER1L4A9Z1Z3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
FER1L4A9Z1Z3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
FER1L4A9Z1Z3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC44.81■■■■■ 4.76
FER1L4A9Z1Z3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
FER1L4A9Z1Z3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
FER1L4A9Z1Z3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
FER1L4A9Z1Z3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms