Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.49■■■■■ 6.47
EFCAB5A4FU69 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.62■■■■■ 6.33
EFCAB5A4FU69 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.09■■■■■ 6.25
EFCAB5A4FU69 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.74■■■■■ 6.19
EFCAB5A4FU69 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.71■■■■■ 6.19
EFCAB5A4FU69 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
EFCAB5A4FU69 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.54■■■■■ 6.16
EFCAB5A4FU69 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.24■■■■■ 6.11
EFCAB5A4FU69 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.21■■■■■ 5.95
EFCAB5A4FU69 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.15■■■■■ 5.94
EFCAB5A4FU69 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.08■■■■■ 5.93
EFCAB5A4FU69 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC52.06■■■■■ 5.92
EFCAB5A4FU69 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
EFCAB5A4FU69 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.89■■■■■ 5.9
EFCAB5A4FU69 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.85■■■■■ 5.89
EFCAB5A4FU69 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
EFCAB5A4FU69 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
EFCAB5A4FU69 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
EFCAB5A4FU69 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.28■■■■■ 5.8
EFCAB5A4FU69 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
EFCAB5A4FU69 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
EFCAB5A4FU69 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.95■■■■■ 5.75
EFCAB5A4FU69 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.93■■■■■ 5.74
EFCAB5A4FU69 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
EFCAB5A4FU69 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
EFCAB5A4FU69 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
EFCAB5A4FU69 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
EFCAB5A4FU69 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.34■■■■■ 5.65
EFCAB5A4FU69 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC50.05■■■■■ 5.6
EFCAB5A4FU69 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
EFCAB5A4FU69 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.6
EFCAB5A4FU69 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
EFCAB5A4FU69 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.75■■■■■ 5.56
EFCAB5A4FU69 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
EFCAB5A4FU69 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.61■■■■■ 5.53
EFCAB5A4FU69 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
EFCAB5A4FU69 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
EFCAB5A4FU69 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.5■■■■■ 5.52
EFCAB5A4FU69 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.49■■■■■ 5.51
EFCAB5A4FU69 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC49.44■■■■■ 5.5
EFCAB5A4FU69 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.4■■■■■ 5.5
EFCAB5A4FU69 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.35■■■■■ 5.49
EFCAB5A4FU69 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
EFCAB5A4FU69 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
EFCAB5A4FU69 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
EFCAB5A4FU69 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
EFCAB5A4FU69 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
EFCAB5A4FU69 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.67■■■■■ 5.38
EFCAB5A4FU69 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
EFCAB5A4FU69 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
EFCAB5A4FU69 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
EFCAB5A4FU69 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.31■■■■■ 5.32
EFCAB5A4FU69 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
EFCAB5A4FU69 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC48.12■■■■■ 5.29
EFCAB5A4FU69 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.1■■■■■ 5.29
EFCAB5A4FU69 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.08■■■■■ 5.29
EFCAB5A4FU69 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
EFCAB5A4FU69 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
EFCAB5A4FU69 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
EFCAB5A4FU69 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
EFCAB5A4FU69 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
EFCAB5A4FU69 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
EFCAB5A4FU69 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
EFCAB5A4FU69 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
EFCAB5A4FU69 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.95■■■■■ 5.27
EFCAB5A4FU69 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
EFCAB5A4FU69 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.9■■■■■ 5.26
EFCAB5A4FU69 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
EFCAB5A4FU69 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
EFCAB5A4FU69 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
EFCAB5A4FU69 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
EFCAB5A4FU69 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
EFCAB5A4FU69 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.64■■■■■ 5.22
EFCAB5A4FU69 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.64■■■■■ 5.22
EFCAB5A4FU69 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
EFCAB5A4FU69 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.6■■■■■ 5.21
EFCAB5A4FU69 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC47.58■■■■■ 5.21
EFCAB5A4FU69 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
EFCAB5A4FU69 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
EFCAB5A4FU69 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
EFCAB5A4FU69 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
EFCAB5A4FU69 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
EFCAB5A4FU69 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.43■■■■■ 5.18
EFCAB5A4FU69 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
EFCAB5A4FU69 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
EFCAB5A4FU69 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
EFCAB5A4FU69 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
EFCAB5A4FU69 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
EFCAB5A4FU69 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
EFCAB5A4FU69 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
EFCAB5A4FU69 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
EFCAB5A4FU69 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
EFCAB5A4FU69 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
EFCAB5A4FU69 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
EFCAB5A4FU69 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.14
EFCAB5A4FU69 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
EFCAB5A4FU69 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
EFCAB5A4FU69 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
EFCAB5A4FU69 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.11
EFCAB5A4FU69 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.94■■■■■ 5.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms